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SAF2015-66368-P

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EL IMPACTO QUE TIENEN LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES EN EL GENOMA DE UN TUMOR CON 1...

EL IMPACTO QUE TIENEN LOS ELEMENTOS TRANSPONIBLES EN EL GENOMA DE UN TUMOR CON 11.000 AÑOS DE VIDA LOS REORDENAMIENTOS ESTRUCTURALES SOMATICOS (AQUELLOS QUE APARECEN DURANTE LA EVOLUCION DE UN TUMOR) SE HAN ENCONTRADO EN CASI TODOS LOS GENOMAS DEL CANCER ESTUDIADOS EN DETALLE, LA MAYORIA DE LOS ESTUDIOS DE ULTRASECUENCIACION SE... ver más

01/01/2015

USC

Presupuesto desconocido

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 236

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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USC

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE SANTIAGO DE COMPOSTELA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 236

Descripción del proyecto LOS REORDENAMIENTOS ESTRUCTURALES SOMATICOS (AQUELLOS QUE APARECEN DURANTE LA EVOLUCION DE UN TUMOR) SE HAN ENCONTRADO EN CASI TODOS LOS GENOMAS DEL CANCER ESTUDIADOS EN DETALLE, LA MAYORIA DE LOS ESTUDIOS DE ULTRASECUENCIACION SE HAN CENTRADO EN ANALIZAR REORDENAMIENTOS CLASICOS (DELECIONES, AMPLIFICACIONES, INVERSIONES, Y TRANSLOCACIONES), RECIENTEMENTE, EL DESARROLLO DE NUEVOS ALGORITMOS HAN PERMITIDO EL ESTUDIO DE LAS INSERCIONES GENOMICAS, UN TIPO DE VARIANTES ESTRUCTURALES QUE INCLUYE A LOS RETROTRANSPOSONES, UN GRUPO DE ELEMENTOS TRANSPONIBLES (TES) QUE REQUIEREN UN RNAM INTERMEDIARIO PARA MOVILIZARSE,LOS RETROTRANSPOSONES SON ELEMENTOS REPETITIVOS CAPACES DE COPIARSE Y PEGARSE EN NUEVAS LOCALIZACIONES DEL GENOMA HOSPEDADOR, A PESAR DE QUE LA MAYORIA DE INSERCIONES GERMINALES DE TES NO TIENEN EFECTOS FENOTIPICOS, ALGUNOS TES PUEDEN LLEGAR A PROVOCAR GRAVES CONSECUENCIAS, E INCLUSO ENFERMEDAD,POCO SE SABE ACERCA DE HASTA QUE PUNTO LOS TES PUEDEN GENERAR DIVERSIDAD EN CELULAS SOMATICAS Y CONTRIBUIR AL DESARROLLO DEL CANCER, DURANTE LOS ULTIMOS 3 AÑOS, VARIOS ESTUDIOS LLEVARON A CABO LA IDENTIFICACION DE RETROTRANSPOSICION SOMATICA EN GENOMAS TUMORALES, REVELANDO ALTAS TASAS DE TRANSPOSICION EN CIERTOS TIPOS DE CANCER, SIN EMBARGO, LA BAJA TASA DE TRANSPOSICION ENCONTRADA EN LA MAYOR PARTE DE TIPOS DE CANCER, JUNTO CON LA CORTA VIDA DE LOS TUMORES HUMANOS - QUE ESTA NORMALMENTE RESTRINGIDA AL TIEMPO DE VIDA DEL PACIENTE -, HACE MUY DIFICIL EL ESTUDIO DE LOS EFECTOS DE LA COEVOLUCION ENTRE LOS TES Y EL GENOMA TUMORAL HOSPEDADOR, QUE REQUERIRIA UNA COEXISTENCIA MAS LARGA,POR ESTA RAZON, NUESTRO EQUIPO HA ESTADO BUSCANDO UN MODELO APROPIADO PARA EL ESTUDIO DE LA RETROTRANSPOSICION EN CANCER, HEMOS ENCONTRADO EL TUMOR VENEREO TRANSMISIBLE CANINO (CTVT), EL CANCER VIVO MAS ANTIGUO, QUE TIENE 11000 AÑOS, CTVT ES UN CANCER TRANSMISIBLE QUE SE PROPAGA ENTRE LA POBLACION MUNDIAL CANINA MEDIANTE LA TRANSFERENCIA ALOGENICA DE CELULAS TUMORALES VIVAS, LA EVOLUCION DE ESTE TUMOR A LO LARGO DE MILES DE AÑOS, ADEMAS DE SU PREVALENCIA MUNDIAL, LO CONVIERTE EN UN MODELO MUY ATRACTIVO PARA EL ESTUDIO DE PROCESOS MUTACIONALES DE BAJA FRECUENCIA EN CANCER, COMO ES LA RETROTRANSPOSICION,TRAS LA SECUENCIACION DE DOS GENOMAS DE CTVT Y SUS HOSPEDADORES, HEMOS TENIDO LA OPORTUNIDAD DE HACER UNA PRIMERA EXPLORACION DEL PROCESO DE RETROTRANSPOSICION EN CTVT; EN ELLOS HEMOS IDENTIFICADO 700 INSERCIONES QUE ESTABAN PRESENTES SOLAMENTE EN UNO DE LOS DOS GENOMAS, APOYANDO SU ORIGEN SOMATICO, ESTOS RESULTADOS SUGIEREN QUE LA RETROTRANSPOSICION SOMATICA ESTA ACTIVA EN CTVT, LOS EFECTOS DE LA RETROTRANSPOCION SOMATICA A LO LARGO DE UN PERIODO DE 11,000 AÑOS PODRIAN HABER IMPACTADO ENORMEMENTE LA FUNCION DEL GENOMA DE CTVT, A UN NIVEL QUE NUNCA PODREMOS ENCONTRAR EN TUMORES DE CORTA VIDA, COMO SON LOS TUMORES HUMANOS, ESTOS DATOS SUGIEREN QUE CTVT PODRIA RESULTAR UN BUEN MODELO PARA EL ESTUDIO DE LOS EFECTOS DE LA COEVOLUCION ENTRE TES Y GENOMA DEL CANCER EN UN LARGO PERIODO DE TIEMPO,CREEMOS QUE EL ESTUDIO DE LA RETROTRANSPOSICION EN UN CANCER DE VIDA LARGA COMO CTVT, REVELARAN NUEVOS PROCESOS MUTACIONALES EN CANCER DONDE LOS TES ESTAN INVOLUCRADOS, EN ESTE PROYECTO, VAMOS A OBTENER LAS SECUENCIAS DE DNA Y RNA DE 8 TUMORES DE CTVT Y SUS HOSPEDADORES, ANALIZAR LOS PATRONES DE RETROTRANSPOSION SOMATICA EN CTVT, CON LA IDEA DE CARACTERIZAR EL ESCENARIO DE COEVOLUCION A LARGO PLAZO ENTRE TES Y GENOMA DEL CANCER, Y EXTRAPOLAR CONCLUSIONES AL CANCER HUMANO, RETROTRANSPOSICIÓN SOMÁTICA\GENÓMICA DEL CÁNCER\TUMORES TRANSMISIBLES

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