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AGL2011-29446

Financiado
EFECTOROMICA EN COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA: ANALISIS BIOINFORMATICO Y FUNCIONAL...
EFECTOROMICA EN COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA: ANALISIS BIOINFORMATICO Y FUNCIONAL DE PROTEINAS FUNGICAS IMPLICADAS EN LA RESPUESTA A LA ANTRACNOSIS LAS ENFERMEDADES DE LAS PLANTAS SON EL FACTOR DE MAYOR PESO EN CUANTO A LIMITACIONES SOBRE LA PRODUCCION MUNDIAL DE ALIMENTOS. INFORMES RECIENTES SITUAN LAS PERDIDAS EN LAS COSECHAS POR CAUSA DE ENFERMEDADES EN TORNO AL 40%, Y ESP... LAS ENFERMEDADES DE LAS PLANTAS SON EL FACTOR DE MAYOR PESO EN CUANTO A LIMITACIONES SOBRE LA PRODUCCION MUNDIAL DE ALIMENTOS. INFORMES RECIENTES SITUAN LAS PERDIDAS EN LAS COSECHAS POR CAUSA DE ENFERMEDADES EN TORNO AL 40%, Y ESPECIFICAN TAMBIEN QUE DICHAS PERDIDAS SUELEN SER OCASIONADAS POR HONGOS. AL IGUAL QUE OTROS PATOGENOS DE LOS VEGETALES, LOS HONGOS SECRETAN DIVERSIDAD DE PROTEINAS EFECTORAS QUE MODULAN LA INMUNIDAD INNATA DE LAS PLANTAS, PERMITIENDO A LOS PATOGENOS INFECTAR Y COLONIZAR LA PLANTA HOSPEDADORA. DENTRO DEL CAMPO DE LA FITOPATOLOGIA, EL ENTENDER LA MANERA EN QUE LAS PROTEINAS EFECTORAS ALTERAN LA FISIOLOGIA DE LA PLANTA HOSPEDADORA PARA PERMITIR EL DESARROLLO DE INFECCIONES, SE HA CONVERTIDO EN UNO DE LOS PRINCIPALES TEMAS DE INVESTIGACION. EL OBJETIVO DEL PROYECTO QUE SE PROPONE ES PROPORCIONAR UN ANALISIS EN PROFUNDIDAD DEL CONTENIDO, LA EVOLUCION Y LAS FUNCIONES DE LAS PROTEINAS EFECTORAS EN EL HONGO DE LA ANTRACNOSIS DEL MAIZ, COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA. LOS OBJETIVOS SON:1) ANALISIS DE LAS VARIACIONES EN EL GENOMA ENTRE DISTINTAS CEPAS DE COLLETOTRICHUM PROCEDENTES DE UN MISMO Y DE VARIOS HOSPEDADORES. REALIZAREMOS EL RESECUENCIADO AL AZAR (SHOTGUN RESEQUENCING) DE SEIS CEPAS DE C. GRAMINICOLA, QUE INFECTA EL MAIZ, Y DE DOS CEPAS DE C. SUBLINEOLUM, QUE INFECTA EL SORGO. CON ESTA INFORMACION IDENTIFICAREMOS HOMOLOGOS DE LOS GENES EFECTORES DE RAPIDA EVOLUCION, LO QUE NOS PERMITIRA IDENTIFICAR VARIACIONES EN EL CONTENIDO DE LOS GENES TANTO ESPECIFICAS DE LA CEPA COMO ESPECIFICAS DEL HOSPEDADOR. APARTE DEL VALOR QUE TENDRAN EN EL ANALISIS DE LOS EFECTORES, ESTOS DATOS NOS AYUDARAN A COMPRENDER LA RELACION ENTRE LA EVOLUCION DEL GENOMA Y LA ESPECIFICIDAD DEL HOSPEDADOR. 2) ANOTACION MANUAL DEL SECRETOMA DE C. GRAMINICOLA. ANALIZAREMOS Y EDITAREMOS MANUALMENTE TODAS LAS PROTEINAS SECRETADAS PREDICHAS DEL GENOMA, CORRIGIENDO ERRORES EN LOS MODELOS GENICOS ACTUALMENTE DISPONIBLES. 3) ANALISIS COMPARATIVO DE SECRETOMAS FUNGICOS. REALIZAREMOS UNA COMPARACION EN PROFUNDIDAD ENTRE EL SECRETOMA DE C. GRAMINICOLA Y LOS SECRETOMAS DE OTROS PATOGENOS DEL MAIZ, ASI COMO DE PATOGENOS DESTACADOS DE ENTRE LOS QUE NO LO AFECTAN. EL OBJETIVO ES IDENTIFICAR SI EXISTEN ELEMENTOS COMUNES ENTRE PATOGENOS DISTINTOS QUE ACTUEN SOBRE UN MISMO HOSPEDADOR. 4) IDENTIFICACION DEL MIMETISMO MOLECULAR EN HONGOS PATOGENOS DE LAS PLANTAS. MUCHAS PROTEINAS EFECTORAS ACTUAN POR TRANSLOCACION A LA CELULAS DEL HOSPEDADOR E INTERFIRIENDO EN LOS PROCESOS CELULARES NORMALES DEL HOSPEDADOR, UNA FORMA EN QUE ELLO PUEDE SUCEDER ES POR MIMETISMO DE UNA PROTEINA DE LA PLANTA, LO QUE PERMITE A LA PROTEINA EXTRAÑA INTERACTUAR CON COMPUESTOS O PROTEINAS DE LA PLANTA. INVESTIGAREMOS ESTE FENOMENO EN EL C. GRAMINICOLA IDENTIFICANDO EN EL PROTEOMA SECUENCIAS, FORMAS DE ENLACE Y DOMINIOS QUE SON PROPIOS DE LAS PLANTAS PERO QUE NO SUELEN ENCONTRARSE EN HONGOS. 5) IDENTIFICACION DE PROTEINAS EFECTORAS CANDIDATAS EN EL GENOMA DE C. GRAMINICOLA. EMPLEANDO LA TOTALIDAD DE LOS DATOS DISPONIBLES A PARTIR DE LA REALIZACION DE LOS CUATRO PRIMEROS OBJETIVOS, ELABORAREMOS UNA LISTA DE PROTEINAS EFECTORAS PUTATIVAS CODIFICADAS EN EL GENOMA DEL C. GRAMINICOLA. 6). ANALISIS FUNCIONAL DE LAS PROTEINAS EFECTORAS PUTATIVAS DEL C. GRAMINICOLA. COMENZAREMOS A ENTENDER EL PAPEL DE LAS PROTEINAS EFECTORAS EN EL PROCESO DE INFECCION EMPLEANDO UNA VARIEDAD DE ESTUDIOS FUNCIONALES. ENETICA DE HONGOS FITOPATOGENOS\INTERACCION PLANTA-PATOGENO\EVOLUCION\FILOGENOMICA\GENOMICA COMPARADA\BIOINFORMATICA ver más
01/01/2011
USAL
73K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 73K€
Líder del proyecto
UNIVERSIDAD DE SALAMANCA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Total investigadores 1147