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BFU2009-10184

Financiado

DINAMICA EVOLUTIVA Y DE DESARROLLO DE LA RED GENICA GAP

NUESTRO GRUPO ESTA INTERESADO EN COMO LOS CAMBIOS EN LAS REDES GENICAS CONDUCEN A CAMBIOS FENOTIPICOS EN UN ORGANISMO, ESTUDIAMOS LA EVOLUCION DE LA RED GENICA COMPARANDO EL SISTEMA GENICO GAP (IMPLICADO EN LA DETERMINACION DE SEG... ver más

01/01/2009

FUNDACIO PRIVADA C...

169K€

Presupuesto del proyecto: 169K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01

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Participantes

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE R...

Lider

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 169K€

Descripción del proyecto NUESTRO GRUPO ESTA INTERESADO EN COMO LOS CAMBIOS EN LAS REDES GENICAS CONDUCEN A CAMBIOS FENOTIPICOS EN UN ORGANISMO, ESTUDIAMOS LA EVOLUCION DE LA RED GENICA COMPARANDO EL SISTEMA GENICO GAP (IMPLICADO EN LA DETERMINACION DE SEGMENTOS EN EL DESARROLLO TEMPRANO) ENTRE LA MOSCA DE LA FRUTA (DROSOPHILA MELANOGASTER) Y OTRAS ESPECIES DIPTERAS (MOSCAS, DIFERENTES MOSQUITOS), USAMOS UN ENFOQUE INTEGRATIVO - EL METODO DEL CIRCUITO GENICO - QUE COMBINA CUANTIFICACION DE LA EXPRESION GENICA PARA EXTRAER MODELOS MATEMATICOS, LOS CIRCUITOS GENICOS SON HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA EXTRAER INFORMACION REGULATORIA A PARTIR DE DATOS CUANTITATIVOS, PROPONEMOS OBTENER ESTOS DATOS DE LAS DIFERENTES ESPECIES DE DIPTEROS, QUE MUESTRAN MODOS PRIMITIVOS VS DERIVADOS DE LA DETERMINACION DE SEGMENTOS, ESTOS DATOS SE UTILIZARAN PARA ADECUAR LOS MODELOS DE CIRCUITOS GENICOS PARA DEDUCIR LAS INTERACCIONES DE REGULACION GENICA GAP EN CADA ESPECIE, LOS MODELOS RESULTANTES PREDECIRAN QUE CAMBIOS REGULATORIOS SON NECESARIOS Y SUFICIENTES PARA EXPLICAR DIFERENCIAS EN LA EXPRESION GENICA ENTRE ESPECIES, ESTAS PREDICCIONES SE PROBARAN IN VIVO USANDO INTERFERENCIAS RNA Y OTRAS TECNICAS,ADEMAS, UTILIZAREMOS UN ENFOQUE IN SILICO PARA PREDECIR LAS TRANSICIONES EVOLUTIVAS SIMULANDO POBLACIONES DE REDES GENICAS BAJO SELECCION PARA EVOLUCIONAR DESDE MODOS PRIMITIVOS DE LA DETERMINACION DE SEGMENTOS HASTA LOS DERIVADOS, PARA LOGRARLO, NECESITAMOS FORMALISMOS DE MODELADO CAPACES DE REPRODUCIR CORRECTAMENTE LAS PROPIEDADES DE VARIACION DEL SISTEMA, COMPARAREMOS DISTINTOS MODELOS DE REDES GENICAS EN LO QUE SE REFIERE A SU CAPACIDAD DE REPRODUCIR EXPRESIONES GENICAS MUTANTES EN DROSOPHILA, EL MODELO QUE MEJOR DESEMPEÑE ESTA TAREA, SE USARA PARA SIMULACIONES NUMERICAS DE POBLACIONES EVOLUTIVAS DE REDES GENICAS, EN UN PRINCIPIO, USAREMOS REDES REPRODUCIENDO EXPRESION GENICA GAP EN UN DIPTERO PRIMITIVO, ESTAS REDES SE SELECCIONARAN POR SIMILITUD A MODELOS DE EXPRESION DERIVADOS Y SE ANALIZARAN LAS TRAYECTORIAS EVOLUTIVAS RESULTANTES, ESTO CONSTITUYE UNA RECONSTITUCION CUANTITATIVA IN SILICO DE UNA RED DE REGULACION GENICA DE DESARROLLO EN EVOLUCION, TODAVIA NO HEMOS ACABADO ESTE TIPO DE RECONSTITUCION,SI ES SATISFACTORIO, NUESTRO ENFOQUE DE MODELADO BASADO EN DATOS NOS OTORGARA UNA COMPRENSION CUANTITATIVA DE COMO LOS CAMBIOS MOLECULARES A NIVEL DE GENOMA AFECTAN LA DISTRIBUCION DE FENOTIPOS SOBRE LOS QUE PUEDE ACTUAR LA SELECCION, ESTO NOS PERMITIRA COMPRENDER LA NATURALEZA DE LA VARIABILIDAD FENOTIPICA, QUE TIENE EL POTENCIAL DE TRANSFORMAR RADICALMENTE LA METODOLOGIA Y EL MARCO CONCEPTUAL DE LA BIOLOGIA DE DESARROLLO EVOLUTIVO Y DE LA TEORIA EVOLUTIVA EN GENERAL, BIOLOGIA DE DESARROLLO EVOLUTIVA\EVOLUCION DE REDES\INGENIERIA INVERSA\EVOLUCION IN SILICO\MODELOS DE CIRCUITO GENICO\DETERMINACION DE SEGMENTOS\SISTEMA GENICO GAP

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