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BIO2009-13261-C02-02

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DETERMINACION ESTRUCTURAL DE MODULOS DE RECONOCIMIENTO DE SECUENCIAS RICAS EN PR...

DETERMINACION ESTRUCTURAL DE MODULOS DE RECONOCIMIENTO DE SECUENCIAS RICAS EN PROLINA Y SUS COMPLEJOS LAS INTERACCIONES ENTRE DOMINIOS MODULARES DE RECONOCIMIENTO DE SECUENCIAS RICAS EN PROLINA (MRP) Y SUS LIGANDOS SON ESENCIALES PARA EL CORRECTO FUNCIONAMIENTO CELULAR, LA IMPLICACION DE ESTAS INTERACCIONES EN EL DESARROLLO DE NUM... ver más

01/01/2009

UAL

209K€

Presupuesto del proyecto: 209K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE ALMERIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 622

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UAL

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE ALMERIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 622

Presupuesto del proyecto 209K€

Descripción del proyecto LAS INTERACCIONES ENTRE DOMINIOS MODULARES DE RECONOCIMIENTO DE SECUENCIAS RICAS EN PROLINA (MRP) Y SUS LIGANDOS SON ESENCIALES PARA EL CORRECTO FUNCIONAMIENTO CELULAR, LA IMPLICACION DE ESTAS INTERACCIONES EN EL DESARROLLO DE NUMEROSAS PATOLOGIAS HUMANAS HACE DE ESTOS DOMINIOS ATRACTIVAS DIANAS PARA EL DISEÑO DE INHIBIDORES DE SUS INTERACCIONES CON POTENCIAL TERAPEUTICO, EL DISEÑO EFICAZ DE LIGANDOS REQUIERE LA RACIONALIZACION DEL PROCESO BASADA EN LA DISECCION Y COMPRENSION DE LA NATURALEZA DE SUS INTERACCIONES Y DE SUS EFECTOS SOBRE LA COOPERATIVIDAD Y DINAMICA ESTRUCTURAL, EL OBJETIVO FUNDAMENTAL ESTE PROYECTO ES COMPRENDER LAS REGLAS QUE DETERMINAN LA AFINIDAD Y ESPECIFICIDAD DE UNION EN LAS DISTINTAS FAMILIAS DE MRP COMO BASE PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS DE DISEÑO RACIONAL Y PARA LA IDENTIFICACION DE DIANAS DE RELEVANCIA FISIOLOGICA EN UN DETERMINADO GENOMA, PARA ELLO PROPONEMOS EL ESTUDIO DE DISTINTOS MRP HACIENDO USO DE UNA METODOLOGIA MULTIDISCIPLINAR QUE CONJUGA TECNICAS EXPERIMENTALES Y COMPUTACIONALES, LO QUE NOS PERMITIRA ABORDAR EL DISEÑO DE INHIBIDORES INCORPORANDO CONSIDERACIONES TERMODINAMICAS, ESTRUCTURALES, FUNCIONALES Y DINAMICAS, EL TRABAJO SE CENTRARA FUNDAMENTALMENTE EN DOMINIOS REPRESENTATIVOS DE LAS FAMILIAS SH3, WW, Y UEV DE ESPECIAL INTERES BIOMEDICO COMO SON: A) LOS DOMINIOS SH3 DE LOS ONCOGENES SRC, FYN, YES Y ABL Y LOS DOMINIOS WW DEL ONCOGEN YAP65 Y B) LOS DOMINIOS WW Y UEV DE NEDD4 Y TSG101 RESPECTIVAMENTE, IDENTIFICADOS COMO DIANAS CELULARES DE DOMINIOS L VIRICOS, CUYAS INTERACCIONES SON ESENCIALES PARA LA PROPAGACION DE VIRUS COMO EL VIH-1 O EBOLA, PROCEDEREMOS A LA CARACTERIZACION DE ESTOS DOMINIOS Y DE SUS INTERACCIONES CON LIGANDOS CON EL FIN DE 1) EVALUAR LA NATURALEZA Y MAGNITUD DE LAS FUERZAS QUE DIRIGEN LA INTERACCION MEDIANTE TECNICAS CALORIMETRICAS Y ESPECTROSCOPICAS Y EVALUAR ASI LA UNIVERSALIDAD EN LAS DISTINTAS FAMILIAS DE MRP DEL PATRON TERMODINAMICO ANOMALO OBSERVADO PARA DOMINIOS SH3 2) ESTABLECER LA IMPORTANCIA DE LAS INTERACCIONES MEDIADAS POR MOLECULAS DE AGUA INTERFACIALES, CLAVES PARA COMPRENDER EL COMPORTAMIENTO TERMODINAMICO DE DOMINIOS SH3, EN OTRAS FAMILIAS DE MRP EVALUANDO EL PAPEL DE LOS DISTINTOS SITIOS DE HIDRATACION Y UTILIZANDO POSTERIORMENTE ESTA INFORMACION PARA EL DISEÑO RACIONAL 3) ANALIZAR LA INFLUENCIA DE LA UNION DEL LIGANDO EN EL EQUILIBRIO CONFORMACIONAL Y EN LA DINAMICA Y COOPERATIVIDAD ESTRUCTURAL DE LOS DOMINIOS PARA IDENTIFICAR LAS REDES COOPERATIVAS DE TRANSMISION DE INFORMACION MEDIANTE DE TECNICAS DE DINAMICA MOLECULAR Y ALGORITMOS ESPECIALIZADOS 4) IDENTIFICAR LOS DETERMINANTES DE LA ESPECIFICIDAD EN EL RECONOCIMIENTO DE SECUENCIAS RICAS EN PROLINA POR DOMINIOS SH3 Y WW AISLADOS Y EVALUAR EL IMPACTO DE EFECTOS CONTEXTUALES ASOCIADOS A LA PRESENCIA DE DOMINIOS EN TANDEM, PRESTANDO ESPECIAL ATENCION A LAS SECUENCIAS DE CONEXION ENTRE DOMINIOS 5) COMBINAR TECNICAS DE DISEÑO RACIONAL Y TECNICAS DE ¿PHAGE DISPLAY¿ PARA LA IDENTIFICACION Y OPTIMIZACION DE LIGANDOS DE ALTA AFINIDAD DE LAS DIANAS DE DOMINIOS L VIRICOS NEDD4-WW4 Y TSG101-UEV Y 6) CONSTRUIR UN MAPA TERMODINAMICO-ESTRUCTURAL DE LOS SITIOS DE UNION DE DOMINIOS SH3 EN COMPARACION CON OTROS MRP CONJUGANDO LA INFORMACION COMPUTACIONAL Y EXPERIMENTAL QUE NOS PERMITA IDENTIFICAR ELEMENTOS COMUNES Y DIVERGENTES ENTRE DOMINIOS DE UNA MISMA FAMILIA Y ENTRE LAS DISTINTAS FAMILIAS Y QUE FACILITE EL DISEÑO DE LIGANDOS Y LA IDENTIFICACION DE DIANAS EN LAS BASES DE DATOS GENOMICAS, DOMINIOS DE PROTEINAS; RAYOS X; CRISTALO

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