Descripción del proyecto
LAS BACTERIAS ESTAN PRESENTES EN LA MAYORIA DE LOS HABITATS EN LA TIERRA DONDE REALIZAN FUNCIONES ESENCIALES, LA DETECCION Y RESPUESTA AL AMBIENTE, INCLUYENDO ANIMALES Y PLANTAS EN EL CASO DE BACTERIAS COMENSALES Y PATOGENAS, ES EL PRIMER PASO EN LA ADAPTACION Y COLONIZACION BACTERIANA DE UN NICHO, EL AVANCE EN EL CONOCIMIENTO DE COMO SE PRODUCE ESTE PROCESO ES POR TANTO MUY RELEVANTE, EN ESTE PROYECTO SE ESTUDIARA EL PROCESO DE SEÑALIZACION CELULAR BACTERIANA USANDO BACTERIAS DEL GENERO PSEUDOMONAS COMO MODELO, PSEUDOMONAS SON BACTERIAS SAPROFITAS CONOCIDAS POR SU CAPACIDAD PARA COLONIZAR MUCHOS AMBIENTES DIFERENTES, QUE VAN DESDE EL SUELO Y EL AGUA HASTA LAS PLANTAS Y LOS ANIMALES, EL GENERO INCLUYE BACTERIAS PATOGENAS TANTO DE PLANTAS (P, SYRINGAE) COMO DE HUMANOS (P, AERUGINOSA) Y TAMBIEN IMPORTANTES AGENTES DE BIOCONTROL (P, PUTIDA, P, FLUORESCENS Y P, PROTEGENS) CAPACES DE PROTEGER LAS PLANTAS DEL EFECTO DELETEREO DE PATOGENOS, RELACIONADO CON SU ALTA CAPACIDAD DE COLONIZACION, LAS BACTERIAS DEL GENERO PSEUDOMONAS CONTIENEN UNA CANTIDAD IMPRESIONANTE DE SISTEMAS DE SEÑALIZACION Y REGULACION GENICA QUE PERMITEN LA DETECCION DEL MEDIO AMBIENTE, DE ESTOS, LOS FACTORES SIGMA DE FUNCION EXTRACITOPLASMICA (ECF) ESTAN ABUNDANTEMENTE PRESENTES EN PSEUDOMONAS, LA SINTESIS Y ACTIVACION DE LOS FACTORES SIGMA ECF ESTAN MUY REGULADOS Y SOLO SE PRODUCEN EN RESPUESTA A SEÑALES INDUCTORAS ESPECIFICAS, UN PROCESO NORMALMENTE CONTROLADO POR FACTORES ANTI-SIGMA, EN BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS COMO PSEUDOMONAS, LOS FACTORES ANTI-SIGMA SON PROTEINAS DE LA MEMBRANA CITOPLASMATICA QUE TIENEN UN DOMINIO CITOSOLICO PEQUEÑO QUE UNE Y MANTIENE SECUESTRADO EL FACTOR SIGMA ECF EN AUSENCIA DE LA SEÑAL INDUCTORA, Y UN DOMINIO PERIPLASMICO QUE RECIBE LA SEÑAL, MUCHOS FACTORES ECF/ANTI-SIGMA HAN EVOLUCIONADO PARA DETECTAR Y RESPONDER A SEÑALES EXTRACELULARES QUE NO NECESITAN ENTRAR EN LA CELULA PARA PRODUCIR UNA RESPUESTA, ESTO OCURRE A TRAVES DE LA ASOCIACION DEL PAR ECF/ANTI-SIGMA CON UN RECEPTOR DE LA SUPERFICIE BACTERIANA, ESTAS TRES PROTEINAS FORMAN UN SISTEMA DE TRANSFERENCIA DE SEÑALES CONOCIDO COMO SISTEMA DE SEÑALIZACION DE LA SUPERFICIE CELULAR (CSS POR SU NOMBRE EN INGLES CELL-SURFACE SIGNALLING), CSS PARTICIPA EN LA REGULACION DE IMPORTANTES FUNCIONES BACTERIANAS COMO LA CAPTACION DE HIERRO Y LA PRODUCCION DE SIDEROFOROS, LA VIRULENCIA, LA SECRECION, LA COMPETENCIA BACTERIANA Y LA PRODUCCION DE TOXINAS ANTIMICROBIANAS, ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO ESTUDIAR LAS CARACTERISTICAS DESCONOCIDAS E IDENTIFICAR NUEVAS FUNCIONES DE ESTE IMPORTANTE SISTEMA DE TRANSDUCCION DE SEÑALES BACTERIANAS: 1) DESENTRAÑANDO EL MECANISMO MOLECULAR QUE HAY DETRAS DE LA ACTIVACION DE LOS SISTEMAS CSS, Y 2) ESTUDIANDO EL PAPEL DE LOS SISTEMAS CSS EN LA INTERACCION BACTERIANA CON OTROS ORGANISMOS E IDENTIFICANDO LAS SEÑALES AMBIENTALES Y DEL HOSPEDADOR QUE PRODUCEN LA ACTIVACION DE LOS MISMOS, ESTO PROPORCIONARA LOS CONOCIMIENTOS NECESARIOS PARA DISEÑAR ESTRATEGIAS PARA DESREGULAR ESTOS CIRCUITOS E INHIBIR O POTENCIAR IMPORTANTES PROCESOS BACTERIANOS, ADEMAS, LOS FACTORES CSS ANTI-SIGMA SE ESTUDIARAN EN ESTE PROYECTO COMO PROTEINAS MODELO PARA IDENTIFICAR LOS DETERMINANTES CLAVE DE UNA REACCION AUTOPROTEOLITICA ESPONTANEA INDEPENDIENTE DE ENZIMA, CON EL OBJETIVO DE UTILIZARLA PARA GENERAR PROTEINAS CON CAPACIDAD AUTOPROTEOLITICA, ESTO PODRIA EXPLOTARSE PARA SIMPLIFICAR EL PROCESO DE PRODUCCION DE MUCHAS PROTEINAS DE INTERES BIOTECNOLOGICO O FARMACEUTICO, PSEUDOMONAS\REGULACIÓN GÉNICA\SEÑALIZACIÓN CELULAR\FACTOR SIGMA\PROTEOLISIS\VIRULENCIA\INTERACCIONES HOSPEDADOR-PATÓGENO\BIOCONTROL