RTC-2015-3693-1
Financiado
DESARROLLO DEL SISTEMA "ONCOFINDER" PARA LA DETECCIÓN Y PROGNOSIS DE TUMORES MED...
DESARROLLO DEL SISTEMA "ONCOFINDER" PARA LA DETECCIÓN Y PROGNOSIS DE TUMORES MEDIANTE BIOMARCADORES LIPÍDICOS UTILIZANDO MICROARRAYS DE MEMBRANAS CELULARES. PROYECTO "ONCOFINDER"
Basándonos en resultados previos, planteamos en el presente proyecto el desarrollo del sistema Oncofinder para la detección y prognosis de tumores mediante biomarcadores lipídicos utilizando microarrays de membranas celulares, E...
Basándonos en resultados previos, planteamos en el presente proyecto el desarrollo del sistema Oncofinder para la detección y prognosis de tumores mediante biomarcadores lipídicos utilizando microarrays de membranas celulares, El objetivo del proyecto Oncofinder será por tanto la puesta a punto de una plataforma integrada que permita identificar de una manera rápida y precisa la presencia de células tumorales o incluso pre-tumorales en muestras complejas procedentes de pacientes mediante el estudio de dichos biomarcadores, Para ello será necesario, por un lado, culminar la validación de estos marcadores lipídicos en una cohorte de muestras mayor de entre 100 y 300 pacientes correctamente diagnosticados, Estos resultados, además de utilizarse en dicha validación, permitirán crear una base de datos con la que entrenar el software de análisis basado en inteligencia artificial, cuyo desarrollo también se plantea en este proyecto, Por otro lado, es requisito imprescindible el diseño, elaboración y optimización del IMaGchip, prototipo de microdispositivo constituido por líneas celulares modelo de enfermedad, patrones lipídicos y sus respectivos controles, que permita la deposición sencilla de la muestra problema (biopsia de tejido en el caso del melanoma y cáncer de colon o células escamadas aisladas de las heces en el caso del cáncer de colon), su análisis espectrométrico, la correcta normalización de los perfiles lipídicos y el adecuado estudio de los biomarcadores seleccionados, Para ello, será necesario el desarrollo de un software de análisis que automáticamente realice las calibraciones y normalizaciones oportunas de manera que, al final del proceso, se obtenga un informe con el resultado, sin necesidad de mano de obra con alta cualificación técnica en el manejo de herramientas bioinformáticas, La obtención de un programa robusto y de manejo simple es clave en el proyecto Oncofinder ya que esta plataforma tiene que ser fácilmente implementada en los laboratorios de diagnóstico, motivo por el cual se utilizarán algoritmos de inteligencia artificial basados en redes neuronales,Los desarrollos experimentales que se plantean en este proyecto se fundamentan en la tecnología y la dilatada experiencia del consorcio en este campo, Concretamente IMG Pharma empleará para el desarrollo del IMaGchip la tecnología patentada de fabricación de microarrays (EP 1930727 B1) que permite inmovilizar membranas o células manteniendo la composición proteica y lipídica a soportes de vidrío (EP 2048534 A4), Asimismo, implementará algoritmos propios desarrollados por personal especializado de la empresa en el software de análisis, El grupo de la UPV/EHU del departamento de Biología Celular participará en la recogida, procesamiento y caracterización de las muestras de cáncer de piel y de tejido sano, funciones que realizará de la Unidad de Investigación del Hospital Universitario Son Espases (HUSE) funciones que realizará el grupo de Lípidos en Patología Humana la Unidad de Investigación del Hospital Universitario Son Espases (HUSE) con las muestras de cáncer de colon y de tejido control, Los grupos de Fisiología y Espectroscopía y Espectrometría de Masas (GEsEM) de la UPV/EHU intervendrán en la puesta a punto de protocolos, adquisición de los perfiles lipídicos e identificación de lípidos, No obstante, y dado el carácter multidisciplinar del proyecto Oncofinder, se realizará el seguimiento científico-técnico del mismo programándose las reuniones del consorcio con la continuidad necesaria para asegurar el cumplimiento de los objetivos y la puesta en común de los resultados, de modo que se puedan recoger las aportaciones de todos los miembros del consorcio, Asimismo se pondrá especial cuidado en no perder la perspectiva de mercado, de manera que al término del proyecto se cuente con una plataforma fácilmente asimilable por los laboratorios de diagnóstico a los que va dirigido,
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
800K€
Líder del proyecto
IMG PHARMA BIOTECH
Análisis masivo de fármacos. servicios de investigación avanzada
Perfil tecnológico
TRL
3-4
261K
Perfil tecnológico
TRL
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