Descripción del proyecto
LA DEPRESION CONSANGUINEA DE LA EFICACIA BIOLOGICA ES UN FENOMENO DE GRAN IMPORTANCIA EVOLUTIVA, CON CONSECUENCIAS CRITICAS SOBRE EL RIESGO DE EXTINCION DE LAS POBLACIONES AMENAZADAS Y DE GRAN INTERES PRACTICO, TANTO EN EL DISEÑO DE PROGRAMAS DE MEJORA GENETICA Y DE CONSERVACION COMO EN LA ELABORACION DE DIRECTRICES PARA LA GESTION DE LA BIODIVERSIDAD, SIN EMBARGO, LA DEPRESION CONSANGUINEA DE LA EFICACIA PUEDE REDUCIRSE DRASTICAMENTE POR EL INCREMENTO DE LA INTENSIDAD DE SELECCION NATURAL EN CONTRA DE GENES DELETEREOS PARCIALMENTE RECESIVOS, INCREMENTO DESENCADENADO POR LA CONSANGUINIDAD Y CONOCIDO COMO PURGA, RECIENTEMENTE NUESTRO EQUIPO DE INVESTIGACION HA REALIZADO IMPORTANTES CONTRIBUCIONES EN EL DESARROLLO DE MODELOS PREDICTIVOS DE LA DEPRESION QUE INCORPORAN LAS CONSECUENCIAS DE LA PURGA, ASI COMO EN LA ESTIMACION DE LA MAGNITUD DE ESTA, EN ESTE PROYECTO NOS PROPONEMOS ABORDAR LOS SIGUIENTES ASPECTOS DEL FENOMENO DE LA PURGA:-LAS ECUACIONES PREDICTIVAS DESARROLLADAS ANTERIORMENTE POR NUESTRO EQUIPO PARA POBLACIONES CON REGISTRO GENEALOGICO REFERIAN A UNA SITUACION SIN SOLAPAMIENTO DE GENERACIONES Y ERAN COMPUTACIONALMENTE POCO MANEJABLES, NOS PROPONEMOS DESARROLLAR ECUACIONES MAS GENERALES Y EFICIENTES PARA LA PREDICCION DE LA PURGA, - HASTA EL PRESENTE, EL SOFTWARE UTILIZADO PARA DETECTAR LA PURGA A PARTIR DE DATOS EXPERIMENTALES, Y PARA PREDECIR SUS CONSECUENCIAS SOBRE LA EFICACIA BIOLOGICA, NO UTILIZABAN LAS ECUACIONES PREDICTIVAS CON PURGA, NOS PROPONEMOS DESARROLLAR SOFTWARE LIBRE PARA LA ESTIMACION DE LA INTENSIDAD DE LA PURGA Y LA PREDICCION DE SUS CONSECUENCIAS SOBRE LA VIABILIDAD DE LAS POBLACIONES, LA POTENCIA Y ROBUSTEZ DE ESTE SOFTWARE SE EVALUARA MEDIANTE SIMULACION EN ORDENADOR, - LAS ECUACIONES PREDICTIVAS DESARROLLADAS POR NUESTRO EQUIPO HASTA LA FECHA REFIEREN A UNA SITUACION SIMPLIFICADA EN LA QUE SE NO SE CONSIDERA EL DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO, NOS PROPONEMOS INVESTIGAR MEDIANTE SIMULACION LAS CONSECUENCIAS DEL LIGAMIENTO SOBRE: 1) EL LASTRE DE CONSANGUINIDAD OCULTO EN HETEROCIGOSIS EN LAS POBLACIONES, 2) SU EXPRESION BAJO CONSANGUINIDAD, CON O SIN PURGA, Y 3) LA EVOLUCION DE LA VARIABILIDAD GENETICA SELECTIVA Y NEUTRA DE LAS POBLACIONES AMENAZADAS,- REALIZADAS LAS COMPROBACIONES ANTERIORES, PROCEDEREMOS A ESTIMAR LA INTENSIDAD DE LA PURGA EN POBLACIONES PEQUEÑAS DE GENEALOGIA CONOCIDA UTILIZANDO DATOS DE ZOOLOGICOS Y DE RAZAS GANADERAS AUTOCTONAS,- COMPROBAR EMPIRICAMENTE LAS IMPLICACIONES PRACTICAS DE LOS ANTERIORES RESULTADOS SOBRE LA VARIABILIDAD GENETICA MOLECULAR DE POBLACIONES EXPERIMENTALES DE DROSOPHILA MELANOGASTER,-ADEMAS , REALIZAREMOS UN ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICA (GWAS) PARA DETECTAR REGIONES GENOMICAS SOMETIDAS A PURGA EN UNA POBLACION DE INTERES GANADERO, - POR ULTIMO, NUESTRO EQUIPO VIENE REALIZANDO IMPORTANTES APORTACIONES AL ESTUDIO DE LA CONTRIBUCION DE LA EPISTASIA A LA VARIABILIDAD GENETICA DE LOS CARACTERES CUANTITATIVOS Y SUS CONSECUENCIAS TRAS LA REDUCCION DEL CENSO POBLACIONAL, EN ESTE SENTIDO NOS PROPONEMOS AMPLIAR ESTOS ESTUDIOS EXPLORANDO MEDIANTE SIMULACION LAS CONSECUENCIAS DE MODELOS EPISTATICOS MAS GENERALES, ASI COMO ANALIZANDO LA CONTRIBUCION DE LA EPISTASIA A LA DETERMINACION DE LA VARIABILIDAD GENETICA NO DETECTADA EN ESTUDIOS GENOMICOS ( LA DENOMINADA "HEREDABILIDAD PERDIDA" EN ANALISIS GWAS), PURGA\DEPRESIÓN CONSANGUÍNEA\GENEALOGÍA\VARIABILIDAD GENÉTICA\DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO\CENSO EFECTIVO