Descripción del proyecto
EL PROYECTO IRIS-FACTORY ABORDA, COMO PRIMER Y PRINCIPAL OBJETIVO, LA BIOSINTESIS BIOTECNOLOGICA Y LA OPTIMIZACION DE LA PRODUCCION DE FLAVONOIDES EN LA FACTORIA BACTERIANA STREPTOMYCES ALBUS. LOS FLAVONOIDES SON IMPORTANTES COMPUESTOS BIOACTIVOS VEGETALES PERTENECIENTES A LA FAMILIA DE LOS POLIFENOLES, CON INTERESANTES PROPIEDADES EN EL SECTOR NUTRACEUTICO (ALIMENTOS FUNCIONALES, AROMAS, EDULCORANTES, PIGMENTOS, ANTIOXIDANTES) Y SECTOR FARMACEUTICO (COMPUESTOS ANTIINFLAMATORIOS, BIOACTIVOS ANTIENVEJECIMIENTO CUTANEO, ANTITUMORALES, CARDIOPROTECTORES, FLEBOTROFICOS) , ENTRE OTRAS FUNCIONES EN LAS PLANTAS PRODUCTORAS ORIGINALES (PROTECCION SOLAR UV, ANTIHERBIVOROS, ANTIMICROBIANOS, SEÑALES DE SIMBIOSIS). EN ESTE PROYECTO, LA OPTIMIZACION DE LA BIOSINTESIS DE FLAVONOIDES EN S. ALBUS SE ABORDARA A DIFERENTES NIVELES, ENTRE ELLOS: A) OPTIMIZACION DE LAS CONDICIONES DE CULTIVO A PEQUEÑA ESCALA Y 2 L (INCLUIDO EL DESARROLLO DE UN MEDIO MINIMO DEFINIDO PARA LA PRODUCCION DE FLAVONOIDES), B ) CONSTRUCCIONES GENETICAS MAS ESTABLES PARA LA EXPRESION HETEROLOGA, C) OPTIMIZACION ENZIMATICA DE ENZIMAS CLAVE A LO LARGO DE LAS VIAS BIOSINTETICAS DE LOS FLAVONOIDES, D) USO DE DATOS TRANSCRIPTOMICOS PARA MEJORAR LA DISPONIBILIDAD DE PRECURSORES INTRACELULARES DE FLAVONOIDES (INCLUIDOS P-CUMAROIL-COA Y MALONIL-COA), E) EL USO DE DATOS DE TRANSCRIPTOMICA Y METABOLOMICA DESDE HPLC-HRESIMS (PRECURSORES DE FLAVONOIDES, AGLICONES Y SUS PRODUCTOS DERIVADOS EN ESTA BACTERIA) PARA LA IDENTIFICACION (Y DELECION EN EL CROMOSOMA) DE GENES QUE CODIFICAN ENZIMAS INVOLUCRADAS EN EL CATABOLISMO DE FLAVONOIDES Y SUS PRECURSORES, Y PARA EL ESTUDIO DE LAS REDES REGULADORAS GLOBALES, Y F) LA REGULACION A LA BAJA DE LA BIOSINTESIS DE ACIDOS GRASOS COMO UNA FORMA DE DESVIAR LA PRODUCCION INTRACELULAR DE MALONIL-COA HACIA SU USO POR LAS CHALCONA SINTASAS PARA LA BIOSINTESIS DE FLAVONOIDES. LOS ESTUDIOS DE TRANSCRIPTOMICA SE LLEVARAN A CABO EN COLABORACION CON EL GRUPO DEL PROF. EDUARD KERKHOVEN, DEL DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA E INGENIERIA BIOLOGICA DE LA UNIVERSIDAD TECNOLOGICA DE CHALMERS (SUECIA). ESTAS OPTIMIZACIONES DE INGENIERIA GENETICA Y METABOLICA DEL HOSPEDADOR BACTERIANO UTILIZARAN TECNOLOGIA CRISPR (A NIVEL DE GENOMA) Y TECNICAS DE CLONACION DE GIBSON Y GOLDEN GATE, CON EL FIN DE REDUCIR EL TIEMPO DE DISEÑO Y CREACION DE LAS NUEVAS RONDAS DE CEPAS MEJORADAS. TODOS ESTOS ENFOQUES SE PROBARAN SOBRE EL RENDIMIENTO BIOSINTETICO DE DOS TIPOS DE COMPUESTOS FLAVONOIDES, LAS ANTOCIANIDINAS (INCLUYENDO SUS DERIVADOS GLUCOSILADOS Y METILADOS COMO COMPUESTOS FINALES DIANA) Y SUS DERIVADOS BIOSINTETICOS, LOS FLAVAN-3-OLES (UTILIZANDO GALATO DE EPIGALOCATEQUINA GALATO COMO COMPUESTO FINAL). LA OPTIMIZACION DE LAS PRODUCCIONES FINALES DE ESTOS COMPUESTOS EN ESTA FACTORIA BACTERIANA ABRIRA EL CAMINO HACIA SU AMPLIO USO PARA LA PRODUCCION BIOTECNOLOGICA A ESCALA INDUSTRIAL, COMO ALTERNATIVA A LOS PRODUCTORES VEGETALES, NO SOLO PARA ESTAS DOS SUBFAMILIAS DE FLAVONOIDES, SINO PARA OTROS TIPOS. EL PROYECTO IRIS-FACTORY ABORDA COMO SEGUNDO OBJETIVO PRINCIPAL, LA APLICACION FARMACEUTICA DE LOS COMPUESTOS OBJETIVO FINALES, QUE SERAN PROBADOS FRENTE A LINEAS CELULARES HUMANAS PARA EL CANCER COLORRECTAL (ESTUDIOS DE COTERAPIA), ASI COMO EN UN ENSAYO PRECLINICO EN RATAS PARA ESTA ENFERMEDAD. ESTOS ESTUDIOS IN VIVO CONTRIBUIRAN A DILUCIDAR LA BASE MOLECULAR DE LA ACCION DE ESTOS COMPUESTOS EN ESTE CARCINOMA, EL MAS COMUN EN LA UE, CON 19% DEL TOTAL DE CASOS Y EL 50% DE LAS MUERTES POR CANCER. LAVONOIDES\OPTIMIZACION DE LA PRODUCCION\INGENIERIA METABOLICA\TRANSCRIPTOMICA\NUTRACEUTICO\ANTITUMORAL\FLAVAN-3-OLES\ANTOCIANIDINAS