DEL DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES AL FENOTIPO METABOLICO TRANSLACIONAL. DESARR...
DEL DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES AL FENOTIPO METABOLICO TRANSLACIONAL. DESARROLLOS Y ESTRATEGIAS EN LA NUEVA ERA DE LA METABOLOMICA
EN METABOLOMICA NO DIRIGIDA AUN HAY DESAFIOS POR ABORDAR, COMO OBTENER IDENTIFICACIONES FIABLES Y TRATAR LA ENORME CANTIDAD DE DATOS. TAMBIEN LA OPTIMIZACION DE METODOLOGIA DIRIGIDA A METABOLITOS TRAZA. EL OBJETIVO PRINCIPAL ES D...
EN METABOLOMICA NO DIRIGIDA AUN HAY DESAFIOS POR ABORDAR, COMO OBTENER IDENTIFICACIONES FIABLES Y TRATAR LA ENORME CANTIDAD DE DATOS. TAMBIEN LA OPTIMIZACION DE METODOLOGIA DIRIGIDA A METABOLITOS TRAZA. EL OBJETIVO PRINCIPAL ES DESARROLLAR ESTRATEGIAS DE IDENTIFICACION FIABLE DE METABOLITOS Y DE CUANTIFICACION DE METABOLITOS CLAVE. PROPONEMOS 8 OBJETIVOS ESPECIFICOS:1. AMPLIAR CAPACIDADES POR GC-QTOF-MSEL AIRE EXHALADO ES UNA MUESTRA NO INVASIVA, MUY RICA EN COMPUESTOS ORGANICOS VOLATILES VOCS. CARACTERIZAREMOS EL PERFIL DE VOCS Y LOS CUANTIFICAREMOS EN ESTUDIO DE HIPOXIA MEDIANTE MICROEXTRACCION EN FASE SOLIDA.TAMBIEN ESTUDIAREMOS EL PAPEL DE LA MICROBIOTA INTESTINAL EN LA FISIOLOGIA Y LA HOMEOSTASIS POR PROCEDIMIENTO OPTIMIZADO CON APROXIMACION NO DIRIGIDA EN HECES.2. AMPLIAR CAPACIDADES POR CE-MSIDENTIFICAREMOS AMINOACIDOS MODIFICADOS EN MUESTRAS REALES EN DIFERENTES CONDICIONES MEDIANTE UNA ESTRATEGIA DE ELUCIDACION DESARROLLADA PREVIAMENTE POR EL CEMBIO. OPTIMIZAREMOS METODOLOGIA DIRIGIDA PARA POLIAMINAS COMO MARCADORES DE ENVEJECIMIENTO Y ENFERMEDAD. 3. AMPLIAR CAPACIDADES DE IDENTIFICACION POR LC-MS-QTOFABORDAREMOS DOS DESAFIOS: CARACTERIZACION DEL PERFIL LIPIDICO POR LC-MS CON IDENTIFICACION FIABLE Y ELUCIDACION ESTRUCTURAL EN MUESTRAS REALES PARA GENERAR ATLAS (COVID Y TUBERCULOSIS) Y BASE DE DATOS DE LIPIDOS OXIGENADOS. INCORPORAREMOS, ENTRE OTRAS, ESTRATEGIAS DE GENERACION DE ESTANDARES IN VITRO.4. AMPLIAR CAPACIDADES DE METABOLOMICA DIRIGIDA POR LC-QQQ-MSALGUNOS METABOLITOS, COMO LOS DERIVADOS DE LA ACTIVIDAD DE LA MICROBIOTA INTESTINAL, NO SE TRATAN ADECUADAMENTE CON LOS ENFOQUES NO DIRIGIDOS HABITUALES Y SE ABORDARAN AQUI EN MODO DIRIGIDO DESPUES DE DERIVATIZACION PARA AUMENTAR LA SENSIBILIDAD Y SELECTIVIDAD Y CON CUANTIFICACION CON PATRONES ISOTOPICAMENTE MARCADOS: I) SCFA Y II) METABOLITOS QUIRALES. UNA VEZ OPTIMIZADO, EL METODO SERA VALIDADO Y APLICADO A ESTUDIOS EN CURSO.5. DESARROLLO DE ESTRATEGIAS PARA EL TRATAMIENTO RACIONAL Y SISTEMATICO DE DATOSESTUDIAREMOS EN PROFUNDIDAD LA APLICABILIDAD DEL ANALISIS MULTIVARIANTE MULTIBLOQUE Y LOS DIFERENTES METODOS DE IMPUTACION Y NORMALIZACION. NUESTRO OBJETIVO: DESARROLLAR UNA ESTRATEGIA ROBUSTA CON PUNTOS DE DECISION Y CRITERIOS CLARAMENTE ESTABLECIDOS PARA PROCEDER SEGUN ALTERNATIVAS. EXPLORAREMOS COMO MEJORAR SISTEMATICAMENTE ESTRATEGIAS CUANDO LA AGRUPACION ESPERADA NO PROPORCIONA UNA BUENA CLASIFICACION DE LAS MUESTRAS, ASI COMO EL ESTUDIO DE COVARIABLES EN METABOLOMICA. ADEMAS, ESTA INFORMACION SE COMPLETARA CON UNA ADECUADA CONSTRUCCION DE REDES BIOQUIMICAS Y ANALISIS DE RUTAS.6. DESARROLLO DE LA HERRAMIENTA CEU MASS MEDIATORDISEÑAREMOS DIVERSAS SOLUCIONES INFORMATICAS PARA GUIAR A TRAVES DEL PROCESO DE ANOTACION / IDENTIFICACION Y MEJORARLO: I) BASADAS EN PRECISION Y MEMORIA INCLUYENDO SISTEMAS DE EVALUACION DE DATOS EXPERIMENTALES INTELIGENTES PARA COMBINAR CON LA ANOTACION. II) ABORDAREMOS LA PREDICCION FIABLE DE TR UTILIZANDO TECNICAS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO Y EL USO EFECTIVO DE LA MOVILIDAD COMO PROPIEDAD ORTOGONAL. III) HERRAMIENTAS DE AYUDA PARA LA EVALUACION DE LA CALIDAD DEL ESPECTRO MS/MS.7. DESARROLLO DEL SENSOR OPTICOACERCANDONOS A LA ETAPA TRASLACIONAL, DISEÑAREMOS Y FABRICAREMOS NANOSENSORES HIBRIDOS PLASMONICOS PARA RESPONDER SELECTIVAMENTE A ALGUNOS DE LOS POTENCIALES MARCADORES DE NUESTROS ESTUDIOS.8. APLICACIONESA MUESTRAS DE COLABORADORES: TRASTORNOS ALIMENTARIOS, ENFERMEDADES INFECCIOSAS/NEURODEGENERATIVAS ETABOLOMICA\HERRAMIENTAS ONLINE\SENSOR\OBESIDAD\MICROBIOMA\LIPIDOS OXIGENADOS\EPIMETABOLITOS\ANALISIS QUIRAL\BASE DE DATOS\IDENTIFICACIONver más
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