Descripción del proyecto
EL PRESENTE PROYECTO PRETENDE SER UNA CONTINUACION DEL PROYECTO COMPUTACION CELULAR: APLICACIONES A LA BIOLOGIA DE SISTEMAS Y A LA BIOLOGIA SINTETICA, QUE ESTA SIENDO EJECUTADO EN LA ACTUALIDAD Y EN EL QUE SE HAN DESARROLLADO MODELOS DE SISTEMAS BIOLOGICOS Y HERRAMIENTAS INFORMATICAS ASOCIADAS QUE PERMITEN LA FORMULACION DE HIPOTESIS PLAUSIBLES CON EL FIN ULTIMO DE CONTRIBUIR A UN AVANCE EN EL CONOCIMIENTO ACERCA DE LOS SISTEMAS OBJETOS DE ESTUDIO.EL PROYECTO SE DESARROLLA EN EL MARCO DE LA COMPUTACION CELULAR CON MEMBRANAS (MEMBRANE COMPUTING) Y SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE NUEVOS PARADIGMAS DE MODELIZACION DE PROCESOS QUE REPRESENTEN UNA ALTERNATIVA REAL A LOS MODELOS BASADOS EN ECUACIONES DIFERENCIALES, REDES DE PETRI, SISTEMAS BASADOS EN AGENTES O ALGEBRA DE PROCESOS.ENTRE LOS OBJETIVOS GENERALES DEL PROYECTO DESTACAMOS LOS SIGUIENTES:(1) DISEÑO DE SISTEMAS CELULARES MULTICOMPARTIMENTALES CON LA EXPRESIVIDAD SUFICIENTE PARA REPRESENTAR ENTIDADES E INTERACCIONES ENTRE ELLAS Y QUE INCLUYAN UN COMPONENTE PROBABILISTICO/ESTOCASTICO, ESPECIFICANDO SU SEMANTICA DE MANERA QUE SE PUEDA REALIZAR UN ESTUDIO COMPUTACIONAL DE SU EVOLUCION.(2) MODELIZACION DE PROCESOS COMPLEJOS QUE SE DAN EN LA NATURALEZA, TANTO A NIVEL DE ECOSISTEMAS COMO A NIVEL MOLECULAR, EN EL AMBITO DE LA BIOLOGIA DE SISTEMAS, A FIN DE ENTENDER SU DINAMICA Y PROPIEDADES DESDE UN PUNTO DE VISTA COMPUTACIONAL.(3) DESARROLLO DE HERRAMIENTAS SOFTWARE IMPLEMENTADAS SOBRE ARQUITECTURAS PARALELAS DE ALTO RENDIMIENTO PARA LA SIMULACION DE SISTEMAS CELULARES. SE ESTUDIARAN DOS ALTERNATIVAS: GPU (GRAPHICAL PROCESSING UNIT) Y FPGA (FIELD PROGRAMMABLE GATE ARRAYS).(4) APLICACION DE LOS MODELOS Y SOFTWARE DESARROLLADOS A CASOS DE ESTUDIO RELEVANTES EN LA ECOLOGIA Y BIOLOGIA MOLECULAR, PERMITIENDO LA FORMULACION DE HIPOTESIS PLAUSIBLES SOBRE ASPECTOS DE LOS FENOMENOS INVESTIGADOS.