Descripción del proyecto
LA COMPRENSION DEL ORIGEN Y MANTENIMIENTO DE LAS ESPECIES, ES DECIR, POR QUE LOS ORGANISMOS SE DIVIDEN EN GRUPOS DISCRETOS GENERANDO LA BIODIVERSIDAD, ES LA CUESTION CENTRAL Y MAS IMPORTANTE TODAVIA SIN RESOLVER EN BIOLOGIA EVOLUTIVA, SE TRATA, NO SOLO DE UNA CUESTION FUNDAMENTAL A NIVEL ACADEMICO, SINO QUE TAMBIEN ES CLAVE PARA LA TOMA DE DECISIONES SOBRE LA CONSERVACION DE LA BIODIVERSIDAD Y LA GESTION DE LOS SERVICIOS DEL ECOSISTEMA EN UN MUNDO CAMBIANTE, ESTE PROYECTO COORDINADO SE CENTRARA EN LAS BIOTAS DE LAS ISLAS OCEANICAS, RECONOCIDAS DESDE HACE TIEMPO COMO EXPERIMENTOS NATURALES SIMPLIFICADOS DE LA EVOLUCION, Y QUE OFRECEN CASOS DE ESTUDIO MANEJABLES PARA LA EVALUACION DE LOS MECANISMOS GENOMICOS SUBYACENTES A LA GENERACION DE LA DIVERSIDAD BIOLOGICA, EN PARTICULAR, SE HAN SELECCIONADO PARA EL ESTUDIO DOS GRUPOS CON UNA GRAN DIVERSIFICACION: LA RADIACION TERRESTRE DE DYSDERA (ARACHNIDA) EN LAS ISLAS CANARIAS, Y LA RADIACION MARINA DE AFRICONUS (GASTROPODA) EN EL ARCHIPIELAGO DE CABO VERDE,EN ESTA PROPUESTA OBTENDREMOS DATOS DEL TRANSCRIPTOMA PARA ENTENDER LOS MECANISMOS GENOMICOS Y LOS PROCESOS EVOLUTIVOS SUBYACENTES A LAS DOS RADIACIONES INSULARES, ASI COMO PARA BUSCAR PATRONES COMUNES A AMBOS SISTEMAS MODELO, PARA ABORDAR ESTE OBJETIVO GENERAL, COMPARTIDO POR AMBOS SUBPROYECTOS, PROPONEMOS ESTUDIAR LAS CARACTERISTICAS GENOMICAS ASOCIADAS CON LOS PROCESOS DE DIVERSIFICACION GLOBAL Y CON LOS CAMBIOS ECOLOGICOS ESPECIFICOS (EN LA DIETA), QUE HAN OCURRIDO EN LAS RADIACIONES INSULARES, MEDIANTE UN ENFOQUE COMPARATIVO EVOLUTIVO QUE USARA FILOGENIAS ROBUSTAS RECONSTRUIDAS A PARTIR DE DATOS MULTIGENICOS MITOCONDRIALES Y NUCLEARES, ESPERAMOS IDENTIFICAR GENES QUE PARTICIPEN EN LOS PROCESOS EVOLUTIVOS MENCIONADOS Y SUS FUNCIONES, ASI COMO CAMBIOS EN EL NUMERO DE GENES (INCLUYENDO GANANCIAS Y PERDIDAS DE GENES), VARIACIONES GENETICAS (CAMBIOS DE NUCLEOTIDOS Y DE AMINOACIDOS), Y DIFERENCIAS EN LOS PATRONES Y NIVELES DE EXPRESION GENICA, CENTRAREMOS NUESTROS ANALISIS EN DOS CASOS DE ESTUDIO ESPECIFICOS, EL SISTEMA QUIMIOSENSORIAL (EN ESTE SUBPROYECTO), Y EL DE SINTESIS DE CONOTOXINAS (SUBPROYECTO Nº 2), HEMOS ELEGIDO ESTOS CASOS POR NUESTRA EXPERIENCIA PREVIA EN ESTOS CASOS, POR SU GRAN IMPACTO EN LA EFICACIA BIOLOGICA DE LOS INDIVIDUOS, Y SU POTENCIAL IMPLICACION EN LA DIVERSIFICACION, DENTRO DEL CASO DE ESTUDIO DEL SISTEMA QUIMIOSENSORIAL ABORDAREMOS DOS OBJETIVOS: 1) OBTENER INFORMACION SOBRE EL ORIGEN Y EVOLUCION DE LOS GENES Y FAMILIAS DE GENES QUIMIOSENSORIALES DE DYSDERA (Y TAMBIEN EN CHELICERATA), Y 2) IDENTIFICAR LOS CAMBIOS GENOMICOS ASOCIADOS CON LOS CAMBIOS DE DIETA GENERALISTA/ESPECIALISTA,PARA LOGRAR ESTOS OBJETIVOS SERA NECESARIO UTILIZAR DIVERSAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS, MUCHAS DE LAS CUALES SERAN DESARROLLADAS EN EL MARCO DEL PROYECTO, Y QUE QUEDARAN DISPONIBLES GRATUITAMENTE PARA LA COMUNIDAD CIENTIFICA, EN PARTICULAR, 1) CONSTRUIREMOS UN PIPELINE BIOINFORMATICO PARA AUTOMATIZAR EL MANEJO Y ANALISIS DE LOS DATOS TRANSCRIPTOMICOS, 2) DESARROLLAREMOS UNA HERRAMIENTA BIOINFORMATICA PARA IDENTIFICAR MARCADORES MOLECULARES UTILES EN ESTUDIOS DE FILOGENIA Y FILOGEOGRAFIA, Y 3) MEJORAREMOS EL SOFTWARE DNASP PARA FACILITAR LOS ANALISIS EXTENSOS DE DATOS MASIVOS, ARÁCNIDOS\ DYSDERA\ RADIACIÓN EN ISLAS\ TRANSCRIPTÓMICA\ FILOGENÓMICA\ SISTEMA QUIMIOSENSORIAL\ FAMILIAS MULTIGÉNICAS\ DNASP\ SELECCIÓN POSITIVA