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CohesinLooping

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Cohesin mediated chromosomal looping From linear paths to 3D effects

The 3D organization of chromosomes within the nucleus is of great importance to control gene expression. The cohesin complex plays a key role in such higher-order chromosome organization by looping together regulatory elements in... ver más

31/03/2023

NKI AVL

2M€

Presupuesto del proyecto: 2M€

Líder del proyecto

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUTANTO... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2023-03-31

ERC-2017-COG: ERC Consolidator Grant

I+D

Cerrada hace 7 años

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2 Participantes

NKI AVL

2.00M€ | Lider

FICOSA INTERNACIONAL

355.25K€ | Participante

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Duración del proyecto: 61 meses Fecha Inicio: 2018-02-06
Fecha Fin: 2023-03-31

Líder del proyecto

STICHTING HET NEDERLANDS KANKER INSTITUUTANTO... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 2M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto The 3D organization of chromosomes within the nucleus is of great importance to control gene expression. The cohesin complex plays a key role in such higher-order chromosome organization by looping together regulatory elements in cis. How these often megabase-sized looped structures are formed is one of the main open questions in chromosome biology. Cohesin is a ring-shaped complex that can entrap DNA inside its lumen. However, cohesin’s default behaviour is that it only transiently entraps and then releases DNA. Our recent findings indicate that chromosomes are structured through the processive enlargement of chromatin loops, and that the duration with which cohesin embraces DNA determines the degree to which loops are enlarged. The goal of this proposal is two-fold. First, we plan to investigate the mechanism by which chromatin loops are formed, and secondly we wish to dissect how looped structures are maintained. We will use a multi-disciplinary approach that includes refined genetic screens in haploid human cells, chromosome conformation capture techniques, the tracing in vivo of cohesin on individual DNA molecules, and visualization of chromosome organization by super-resolution imaging. With unbiased genetic screens, we have identified chromatin regulators involved in the formation of chromosomal loops. We will investigate how they drive loop formation, and also whether cohesin’s own enzymatic activity plays a role in the enlargement of loops. We will study whether and how these factors control the movement of cohesin along individual DNA molecules, and whether chromatin loops pass through cohesin rings during their formation. Ultimately, we plan to couple cohesin’s linear trajectory along chromatin to the 3D consequences for chromosomal architecture. Together our experiments will provide vital insight into how cohesin structures chromosomes.

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