Descripción del proyecto
LA ALMEJA FINA ES UNA ESPECIE AUTOCTONA DE GRAN INTERES PARA EL DESARROLLO DEL CULTIVO DE ALMEJAS EN ESPAÑA, LA ESPECIE SE CARACTERIZA POR UN CRECIMIENTO LENTO Y UNA GRAN SUSCEPTIBILIDAD AL PARASITO PERKINSUS, EN PROYECTOS ANTERIORES UTILIZAMOS MARCADORES GENETICOS DE DNA MITOCONDRIAL E INTRONES PARA UN ESTUDIO GENETICO POBLACIONAL Y DESCUBRIMOS LA EXISTENCIA DE TRES RAZAS GEOGRAFICAS GENETICAMENTE DIFERENTES (ATLANTICO, MEDITERRANEO OCCIDENTAL Y ORIENTAL), EN ESTE PROYECTO NOS PLANTEAMOS PROFUNDIZAR EL ESTUDIO DE ESTAS RAZAS CON RELACION A CARACTERES DE INTERES PARA LA PRODUCCION, EN PRIMER LUGAR, SE ESTUDIARA SI EXISTEN DIFERENCIAS ENTRE LAS RAZAS ATLANTICA Y MEDITERRANEA OCCIDENTAL PARA LA TASA DE CRECIMIENTO, LA INFESTACION POR PERKINSUS Y LA MADURACION GONADAL, PARA ELLO SE REALIZARA UN ESTUDIO DE 2 POBLACIONES DE CADA RAZA EN UN DISEÑO DE COMMON-GARDEN REPLICADO EN 2 LABORATORIOS, EN SEGUNDO LUGAR, LAS MUESTRAS DEL EXPERIMENTO ANTERIOR SE SOMETERAN A UN ESTUDIO DE GENOMICA FUNCIONAL, CON EL OBJETIVO DE, POR UNA PARTE, DETECTAR GENES CANDIDATOS QUE EXPLIQUEN LA VARIACION FENOTIPICA OBSERVADA EN LOS CARACTERES ESTUDIADOS A NIVEL INTERRACIAL Y/O INTERINDIVIDUAL, Y POR OTRA, DETERMINAR SI EXISTEN PAUTAS DE EXPRESION CARACTERISTICAS DE CADA RAZA, PARA ELLO SE SELECCIONARAN LOS INDIVIDUOS DE CADA POBLACION REPLICADA QUE MANIFIESTEN LOS FENOTIPOS EXTREMOS Y SE SOMETERAN A ANALISIS TRANSCRIPTOMICO MEDIANTE MICROARRAYS DE OLIGONUCLEOTIDOS, A CONTINUACION SE SELECCIONARAN 10-15 GENES QUE PRESENTEN PAUTAS DE EXPRESION DE ESPECIAL INTERES, Y SE MEDIRA SU NIVEL DE EXPRESION EN TODOS LOS INDIVIDUOS DE LA POBLACION MEDIANTE PCR CUANTITATIVO, PARA CORRELACIONAR ESTOS VALORES CON LOS VALORES FENOTIPICOS DE LOS CARACTERES PRODUCTIVOS A NIVEL INDIVIDUAL, FINALMENTE, SE AMPLIARA LA CARACTERIZACION GENETICA DE LAS POBLACIONES EXPERIMENTALES, PARA ELLO SE DESARROLLARAN 30 MARCADORES SNP DISTRIBUIDOS POR TODOS EL GENOMA, A PARTIR DE COLECCIONES DE ESTS YA DISPONIBLES, Y SE SECUENCIARAN 6 GENES CANDIDATOS DE ESPECIAL INTERES,