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SAF2011-30104

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CARACTERIZACION DE LAS ESTRUCTURAS DE GPCRS Y SUS INTERACCIONES CON LIGANDOS: AP...

CARACTERIZACION DE LAS ESTRUCTURAS DE GPCRS Y SUS INTERACCIONES CON LIGANDOS: APLICACIONES AL DISEÑO DE FARMACOS EL EQUIPO SOLICITANTE HA DESARROLLADO RECIENTEMENTE UNA PLATAFORMA BIOINFORMATICA PARA EL ESTUDIO ESTRUCTURAL DE LOS RECEPTORES ACOPLADOS A PROTEINAS G (GPCRS). DICHA PLATAFORMA HA SIDO CONSTRUIDA SOBRE UN ENTORNO WEB A FIN DE FAC... ver más

01/01/2011

FUNDACION PUBLICA...

97K€

Presupuesto del proyecto: 97K€

Líder del proyecto

FUNDACION PUBLICA GALEGA DE MEDICINA XENOMICA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 173K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Participantes

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Líder del proyecto

FUNDACION PUBLICA GALEGA DE MEDICINA XENOMICA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 173K€

Presupuesto del proyecto 97K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL EQUIPO SOLICITANTE HA DESARROLLADO RECIENTEMENTE UNA PLATAFORMA BIOINFORMATICA PARA EL ESTUDIO ESTRUCTURAL DE LOS RECEPTORES ACOPLADOS A PROTEINAS G (GPCRS). DICHA PLATAFORMA HA SIDO CONSTRUIDA SOBRE UN ENTORNO WEB A FIN DE FACILITAR EL ACCESO A TODA LA COMUNIDAD INVESTIGADORA, A LA VEZ QUE ES UTILIZADA A NIVEL INTERNO PARA EL ESTUDIO DE DETERMINADOS GPCRS CON ELEVADO INTERES FARMACOLOGICO. EN LA PRESENTE SOLICITUD SE PRETENDE DAR CONTINUIDAD AL DESARROLLO Y MANTENIMIENTO DE ESTA PLATAFORMA BIOINFORMATICA, INCLUYENDO NUEVOS CAPITULOS COMO SON: I) OBTENCION DE UN ALINEAMIENTO REVISADO DE CADA GPCR HUMANO (CLASE A) CON CADA UNO DE LOS POSIBLES GPCRS DE ESTRUCTURA CONOCIDA; II) CONEXION DE NUESTRO SERVIDOR CON ENTORNOS INFORMATICOS TIPO NUBE (CLOUD COMPUTING) QUE PERMITAN LA SIMULACION DE PROCESOS DINAMICOS A LARGA ESCALA (MICROSEGUNDOS); III) ESTUDIO DE LOS PROCESOS DE DIMERIZACION Y OLIGOMERIZACION DE GPCRS, MEDIANTE TECNICAS DE ANCLAJE Y SIMULACION MOLECULAR. EL RESULTADO DE ESTA RAMA DEL PROYECTO SERA EL PROVEER A LA COMUNIDAD CIENTIFICA DE UNA PLATAFORMA DE REFERENCIA INTERNACIONAL PARA EL ESTUDIO DE TODOS LOS ASPECTOS ESTRUCTURALES RELATIVOS A LOS GPCRSASIMISMO, PRETENDEMOS LLEVAR A CABO ESTUDIOS ESPECIFICOS SOBRE DOS SUBFAMILIAS DE GPCRS, EN COORDINACION CON GRUPOS EXPERIMENTALES QUE APOYAN Y PARTICIPAN EN EL PRESENTE PROYECTO: 1) LA FAMILIA DE LOS RECEPTORES DE ADENOSINA, PARA LOS CUALES CONTAMOS CON EXPERIENCIA PREVIA EN EL DISEÑO DE LIGANDOS. EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS DISEÑAR NUEVAS MOLECULAS QUE ACTUEN COMO MODULADORES QUIMICOS Y HERRAMIENTAS FARMACOLOGICAS. ESTA PARTE SE LLEVARA A CABO EN ESTRECHA COLABORACION CON EL GRUPO DE QUIMICA COMBINATORIA DE LA USC. 2) LOS RECEPTORES DE NEUROPEPTIDO Y, QUE PRESENTAN EL RETO ESTRUCTURAL DE SER ACTIVADOS POR PEPTIDOS DE LONGITUD CONSIDERABLE (36 AMINOACIDOS). EN ESTOS RECEPTORES, AL IGUAL QUE PARA LA MAYORIA DE RECEPTORES QUE UNEN PEPTIDOS, AUN NO HAN SIDO ELUCIDADOS LOS MECANISMOS DE RECONOCIMIENTO DE LIGANDO. PARA CONSEGUIR PRECISAMENTE ESTE OBJETIVO, PLANTEAMOS ESTA RAMA DEL PROYECTO CONTANDO CON LA PARTICIPACION DE UN GRUPO EXPERTO EN LA FARMACOLOGIA DE LOS MISMOS (U. UPPSALA). ECEPTORES ACOPLADOS A PROTEINA G\ESTIMACION DE ENERGIA LIBRE\ANALISIS MULTICOMPONENTE\MUTAGENESIS DIRIGIDA\DINAMICA MOLECULAR\MODELADO POR HOMOLOGIA

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