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BIO2010-17527

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BIOMARCADORES: UNA APROXIMACION DE BIOINFORMATICA FUNCIONAL AL ESTUDIO DE LA REG...

BIOMARCADORES: UNA APROXIMACION DE BIOINFORMATICA FUNCIONAL AL ESTUDIO DE LA REGULACION, LAS RELACIONES FUNCIONALES Y SUS IMPLICACIONES EN LAS DISTINTAS PATOLOGIAS DURANTE LA ULTIMA DECADA, LA INVESTIGACION BIOMEDICA HA EXPERIMENTADO UNA ENORME REVOLUCION PROPULSADA EN GRAN MEDIDA POR LA DISPONIBILIDAD DE SECUENCIAS DE GENOMAS COMPLETOS, ESTA ERA POST-GENOMICA SE HA CARACTERIZADO TAMBIEN PO... ver más

01/01/2010

CSIC

157K€

Presupuesto del proyecto: 157K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 157K€

Descripción del proyecto DURANTE LA ULTIMA DECADA, LA INVESTIGACION BIOMEDICA HA EXPERIMENTADO UNA ENORME REVOLUCION PROPULSADA EN GRAN MEDIDA POR LA DISPONIBILIDAD DE SECUENCIAS DE GENOMAS COMPLETOS, ESTA ERA POST-GENOMICA SE HA CARACTERIZADO TAMBIEN POR EL ACELERADO DESARROLLO DE TECNICAS EXPERIMENTALES DE ALTO RENDIMIENTO CAPACES DE GENERAR ENORMES VOLUMENES DE DATOS, DISPONIBLES HOY EN DIA A LA COMUNIDAD CIENTIFICA, A PESAR DE LOS IMPORTANTES DESARROLLOS QUE SE HAN ALCANZADO EN BIOLOGIA COMPUTACIONAL Y BIOINFORMATICA, EL ANALISIS Y LA INTERPRETACION DE TODA ESTA INFORMACION AUN CONSTITUYE UN GRAN PROBLEMA NO DEL TODO RESUELTO LO QUE IMPLICA QUE TODAVIA ESTEMOS LEJOS DE UNA COMPRENSION GLOBAL DE LAS INTRINCADAS Y COMPLEJAS REDES DE PROCESOS MOLECULARES INVOLUCRADOS EN DISTINTAS ENFERMEDADES, ESTA NECESIDAD DE INTEGRAR Y ANALIZAR ESTOS ENORMES VOLUMENES DE INFORMACION HA MOTIVADO EL DESARROLLO DE MUCHAS APROXIMACIONES METODOLOGICAS EN BIOLOGIA COMPUTACIONES, CAMPO QUE SE CONOCE TAMBIEN COMO BIOINFORMATICA TRASLACIONAL, UNO DE LOS PROBLEMAS FUNDAMENTALES EN ESTE CAMPO ES EL DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES MOLECULARES, UN BIOMARCADOR ES FORMALMENTE DEFINIDO COMO UNA CARACTERISTICA BIOLOGICA QUE SE PUEDE MEDIR Y EVALUAR OBJETIVAMENTE Y PUEDE CARACTERIZAR Y SER INDICADOR DE SI UN PROCESO BIOLOGICO ES NORMAL, PATOLOGICO O UNA RESPUESTA FARMACOLOGICA A UNA INTERVENCION TERAPEUTICA, POR TANTO, UN PRIMER PASO PARA EL DESCUBRIMIENTO DE BIOMARCADORES SE BASA EN ENCONTRAR CUALES SON LOS PATRONES DIFERENCIALES ENTRE DISTINTAS CONDICIONES (POR EJEMPLO ESTADO PATOLOGICO Y ESTADO NORMAL), PATRONES QUE PERMITIRAN SELECCIONAR DESCRIPTORES O FIRMAS MOLECULARES QUE, EN SU COMBINACION CARACTERICEN DE FORMA DIFERENCIAL UN ESTADO FISIOLOGICO Y POR TANTO CONSTITUYAN UN POTENCIAL BIOMARCADOR, DESDE LA PERSPECTIVA DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL, ESTE CAMPO DE INVESIGACION AUN NECESITA EVOLUCIONAR HACIA SISTEMAS AUN MAS INTEGRADORES QUE TENGAN EN CUENTA DISTITNAS APROXIMACIONES METODOLOGICAS A LA VEZ QUE TENGAN EN CUENTA LA REALIDAD EXPERIMENTAL, EL PROYECTO QUE SE SOLICITA TIENE COMO OBJETIVO GENERAL EL DESARROLLO DE APROXIMACIONES DE ANALISIS DESDE UNA PERSPECTIVA COMPUTACIONAL INTEGRADORA, CONCRETAMENTE ORIENTADO A LA DETECCION Y EVALUACION DE BIOMARCADORES MOLECULARES IMPLICADOS EN ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES COMO SON EL INFARTO AL MIOCARDIO, LA ISQUEMIA PERIFERICA Y EL ICTUS CEREBRAL, EN ESTE CONTEXTO METODOLOGICO PROPONEMOS UN FLUJO DE TRABAJO BASADO EN 4 ETAPAS: 1) EL ESTUDIO DE MODULOS REGULATORIOS DE INTERACCION MIRNA-RNA QUE PARTICIPEN COOPERATIVAMENTE EN LA REGULACION GENICA POST-TRANSCRIPCIONAL EN CIERTAS CONDICIONES RELACIONADAS CON LAS ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES, 2) META-ANALISIS QUE COMBINE LOS DATOS EXPERIMENTALES GENERADOS EN ESTE PROYECTO CON DATOS SIMILARES A NIVEL FENOTIPICO QUE ESTEN DISPONIBLES PUBLICAMENTE, ESTO PERMITIRA LA IDENTIFICACION DE GENES CON PATRONES DE CO-REGULACION RECURRENTES Y REPRODUCIBLES EN CIERTAS CONDICIONES EXPERIMENTALES Y QUE POR LO TANTO CONSTITUYAN BIOMARCADORES POTENCIALES, 3) CARACTERIZACION FUNCIONAL DE LOS BIOMARCADORES POTENCIALES UTILIZANDO INFORMACION FUNCIONAL, REGULATORIA Y CONCEPTOS BIOMEDICOS, 4) POR ULTIMO, SE PRETENDE LA EVALUACION IN-SILICO DE LOS POTENCIALES BIOMARCADORES DE ACUERDO A UN CONJUNTO DE CRITERIOS BIOLOGICOS QUE INDIQUEN LA BONDAD DE LOS MISMOS COMO DIFERENCIADORES MOLECULARES DE LAS PATOLOGIAS ESTUDIADAS,

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