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CGL2009-13318-C02-01

Financiado
BIOLOGIA Y ECOLOGIA DE ARCHAEA LACUSTRES NO CULTIVADAS. ECOLOGIA DE POBLACIONES...
BIOLOGIA Y ECOLOGIA DE ARCHAEA LACUSTRES NO CULTIVADAS. ECOLOGIA DE POBLACIONES Y CICLOS BIOGEOQUIMICOS EN LAGOS DE ALTA MONTAÑA LOS MICROORGANISMOS ARCHAEA SON UN COMPONENTE COMUN DEL PLANCTON, PERO LA MAYORIA DE ELLOS HAN PASADO DESAPERCIBIDOS PARA LA LIMNOLOGIA HASTA FECHAS MUY RECIENTES, METANOGENOS, HALOFILOS EXTREMOS Y TERMOFILOS SON BIEN CONOCIDOS, S... LOS MICROORGANISMOS ARCHAEA SON UN COMPONENTE COMUN DEL PLANCTON, PERO LA MAYORIA DE ELLOS HAN PASADO DESAPERCIBIDOS PARA LA LIMNOLOGIA HASTA FECHAS MUY RECIENTES, METANOGENOS, HALOFILOS EXTREMOS Y TERMOFILOS SON BIEN CONOCIDOS, SIN EMBARGO, HA HABIDO UN INCREMENTO ESPECTACULAR EN EL CONOCIMIENTO DE NUEVAS ARCHAEA Y FRECUENTES DESCUBRIMIENTOS SE PRODUCEN DE MANERA CONTINUADA, DESAFORTUNADAMENTE, LA INCAPACIDAD DE CULTIVAR ESTAS ESPECIES IMPIDE CONOCER SU METABOLISMO O PAPEL FUNCIONAL IN SITU, PARA SOLVENTAR ESTAS LIMITACIONES NUEVAS ESTRATEGIAS DE CULTIVO, APLICACION DE TECNICAS MOLECULARES DE ALTA RESOLUCION, APROXIMACIONES BIOGEOQUIMICAS MAS DETALLADAS Y HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS ESTAN DISPONIBLES, POR EJEMPLO, ESTUDIOS RECIENTES REFLEJAN QUE CRENARCHAEOTA PELAGICAS DE AMPLIA DISTRIBUCION TIENEN UN PAPEL BIOGEOQUIMICO CLAVE EN EL CICLO DEL NITROGENO ACTUANDO COMO NITRIFICANTES QUIMIAUTO/MIXO-TROFICOS EN SUELOS Y MEDIO ACUATICO COMPITIENDO DE MANERA EFECTIVA CON BACTERIAS, SIN EMBARGO, TODAVIA EXISTE UNA FALTA DE CONOCIMIENTO BASICO TANTO EN LA BIOLOGIA COMO EN LA ECOLOGIA POBLACIONAL PARA PODER LLEGAR A ENTENDER SU DINAMICA POBLACIONAL Y SU DISTRIBUCION NATURAL, LOS DATOS DISPONIBLES INDICAN VALORES DE ABUNDANCIA ENTRE EL 1-40% DEL BACTERIOPLANCTON (SENSU LATU) TOTAL, Y DE HASTA UN 37% EN LAGOS DE ALTA MONTAÑA, ESTOS LAGOS CONSTITUYEN UN AMBIENTE NO TERMOFILO DE AMPLIA DISTRIBUCION DONDE CRENARCHAEOTA Y EURYARCHAEOTA SE ENCUENTRAN ENRIQUECIDOS DE FORMA NATURAL, ADEMAS, UN ESTUDIO RECIENTE DE DISTRIBUCION GLOBAL REALIZADO POR NUESTRO GRUPO UTILIZANDO BASES DE DATOS PUBLICAS (HASTA 40,000 SECUENCIAS DE 16S RRNA DE ARCHAEA DISPONIBLES) PERMITIO IDENTIFICAR LOS AMBIENTES DE ALTA Y BAJA DIVERSIDAD E IDENTIFICAR AQUELLOS DE MAYOR INTERES, ENTRE ESTOS SE ENCUENTRA EL PLANCTON LACUSTRE MESOFILO/PSICROFILO POR LA GRAN DIVERSIDAD FILOGENETICA DE GRUPOS ARCHAEANOS QUE CONTIENE (CALCULADO COMO LA SUMA DE LA LONGITUD DE LAS RAMAS ASOCIADAS CON TODAS LAS SECUENCIAS RECUPERADAS EN EL CONJUNTO ESTUDIADO) Y EL BAJO VALOR PREDICHO DE 'COVERAGE', POR EL CONTRARIO, EN SUELOS LA DIVERSIDAD ES MUCHO MENOR, POR LO TANTO, LOS ECOSISTEMAS ACUATICOS TERRESTRES EN GENERAL Y LOS LAGOS DE ALTA MONTAÑA EN PARTICULAR OFRECEN EXCELENTES OPORTUNIDADES PARA EXPLORAR LA ECOLOGIA DE UNO DE LOS GRUPOS MICROBIANOS MAS ENIGMATICOS, EL PROYECTO PIRENA ES CONTINUACION DE VIARC (2004-2006) Y CRENYC (2007-2009) Y ANALIZARA LA ECOLOGIA POBLACIONAL Y EL RECICLADO BIOGEOQUIMICO EN LOS 3 GRUPOS MAS ABUNDANTES DE ARCHAEA DETECTADOS EN ESOS AMBIENTES: CRENARCHAEOTAS 1,1A, EURYARCHAEOTAS PISA Y EURYARCHAEOTAS HVFRESH, UTILIZANDO EL OBSERVATORIO LIMNOLOGICO DE PIRINEOS COMO ENTORNO MODELO (LAGOS UBICADOS EN ALTITUDES ENTRE LOS 1,500 Y 3,500 METROS), PLANEAMOS ESTUDIOS IN SITU A LO LARGO DE GRADIENTES CONTRASTADOS PARA SEGUIR SU DINAMICA POBLACIONAL UTILIZANDO TECNOLOGIAS MOLECULARES Y GEOQUIMICAS DE ALTA RESOLUCION PARA DESCRIBIR LA COMPOSICION DE LA COMUNIDAD, 'ASSEMBLY RULES', EVALUACION DEL IMPACTO DE SU ACTIVIDAD EN LOS FLUJOS DE CARBONO Y UNA APROXIMACION METAGENOMICA CON TECNOLOGIA 454 DE PIROSECUENCIACION PARA ANALISIS MASIVO DE SECUENCIAS AMBIENTALES DE ADN, POSTERIOR EXTRACCION DE INFORMACION FUNCIONAL CON TECNICAS DE BIOINFORMATICA ECOLOGICA Y ESTABLECIMIENTO DE VINCULOS CON LOS PROCESOS QUE GOBIERNAN LAS TRANSFORMACIONES BIOGEOQUIMICAS, ARCHAEA\ECOLOGIA MICROBIANA\BIODIVERSIDAD MICROBIANA\METAGENOMICA\CICLO DEL NITROGENO\LIMNOLOGIA ver más
01/01/2009
CSIC
211K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2009-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 211K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M