PID2019-106339GB-I00
Financiado
BIOFISICA DE LA RESPUESTA INMUNE: RECEPTORES, CELULAS Y POBLACIONES
LA RESPUESTA INMUNE INVOLUCRA MULTIPLES ETAPAS OPERANDO A DISTINTAS ESCALAS ESPACIALES Y TEMPORALES, EN LOS ULTIMOS AÑOS ES CADA VEZ MAYOR EL RECONOCIMIENTO DEL PAPEL DE LOS PROCESOS FISICOS EN LA EFICACIA DE LA RESPUESTA, EMPEZAN...
LA RESPUESTA INMUNE INVOLUCRA MULTIPLES ETAPAS OPERANDO A DISTINTAS ESCALAS ESPACIALES Y TEMPORALES, EN LOS ULTIMOS AÑOS ES CADA VEZ MAYOR EL RECONOCIMIENTO DEL PAPEL DE LOS PROCESOS FISICOS EN LA EFICACIA DE LA RESPUESTA, EMPEZANDO POR LA REGION DE CONTACTO FISICO ENTRE CELULAS (LA LLAMADA SINAPSIS INMUNOLOGICA), EN GENERAL, NO SE PUEDE HABLAR DE LA RESPUESTA INMUNE A UNA ESCALA SINO DE UNA INTERACCION ENTRE ESCALAS, POR OTRA PARTE, AUNQUE LA ESTRUCTURA MOLECULAR EXACTA DEL RECEPTOR DE LAS CELULAS T SE HA DESCUBIERTO EN AGOSTO DE 2019, DICHO CONOCIMIENTO NO DETERMINA POR COMPLETO LA RESPUESTA INMUNE POR TRATARSE DE UN PROCESO DINAMICO FUERA DEL EQUILIBRIO, LO QUE REQUIERE UTILIZAR LAS HERRAMIENTAS TRADICIONALES DE LA FISICA ESTADISTICA, EL OBJETIVO CENTRAL DEL PROYECTO ES CUANTIFICAR MEDIANTE EL MODELADO, LA SIMULACION Y EL ANALISIS DE DATOS EL PAPEL DE LOS ASPECTOS BIOFISICOS DE LA RESPUESTA INMUNE OPERANDO A DISTINTAS ESCALAS, SIEMPRE CON EL FOCO EN LA EXPLICACION DE DATOS EXPERIMENTALES, LA DISCRIMINACION ENTRE TEORIAS ALTERNATIVAS Y LA GENERACION DE NUEVAS HIPOTESIS,PARA ALCANZAR ESTE OBJETIVO SE PLANTEA UN ESTUDIO SEPARANDO DICHAS ESCALAS Y ELEGIR LA METODOLOGIA QUE SE ADAPTE MEJOR A LAS CARACTERISTICAS DE LAS MISMAS (CONCENTRACIONES GRANDES/PEQUEÑAS, FLUCTUACIONES, PROPIEDADES ESPACIALES FRENTE A WELL-MIXED, ETC,,,) Y DE LOS DATOS EXPERIMENTALES DISPONIBLES, EN EL NIVEL MOLECULAR, MODELAREMOS LA COOPERACION DE RECEPTORES DE CELULAS T (TCR) PARA DETERMINAR EL MECANISMO DOMINANTE EN LA AMPLIFICACION DE LA SENSIBILIDAD POR NANOCLUSTERS DE TCR, COMBINADO MODELOS ESTOCASTICOS, ANALISIS DE IMAGENES E INFERENCIA BAYESIANA, CUANTIFICAREMOS LA DINAMICA Y FUNCION DE DICHOS NANOCLUSTERS, ESTA APROXIMACION SE EXTENDERA A PROCESOS DE COMPETICION ACTIVADOS POR CITOQUINAS, EN EL NIVEL CELULAR, PLANTEAMOS EL ESTUDIO CUANTITATIVO DE LA DEFORMACION DE CELULAS EN LA SINAPSIS, EN UNA PRIMERA FASE, UTILIZAREMOS UN MODELO EXPERIMENTAL DE UN GRUPO COLABORADOR (CARBONO HIDROTERMAL) PARA VALIDAR MODELOS DE SIMULACION BASADOS EN ELEMENTOS FINITOS Y GENERAR MODELOS EFECTIVOS DE DICHA DEFORMACION, EN UNA SEGUNDA FASE, MODELAREMOS LA MEMBRANA CELULAR UTILIZANDO EL METODO PHASE-FIELD, FINALMENTE, EXTENDEREMOS MODELOS CLASICOS DE LA FISICA ESTADISTICA (MODELO DE SMOLUCHOWSKI) PARA ESTUDIAR LA DINAMICA INTRA-CELULAR DE ORGANULOS EN INFECCIONES VIRICAS,EN EL NIVEL POBLACIONAL, INTRODUCIREMOS MODELOS COMPARTIMENTALES QUE PERMITAN CONTRASTAR HIPOTESIS SOBRE LA DINAMICA DE MADURACION DE LINFOCITOS T EN EL TIMO, CON ESPECIAL ENFASIS EN LA SIMETRIA/ASIMETRIA EN LA SELECCION DE CELULAS DOBLE NEGATIVO, Y UTILIZAREMOS LOS MODELOS PARA EXTRAER EL MECANISMO MAS PARSIMONIOSO A PARTIR DEL ANALISIS DE DATOS EXPERIMENTALES, SIGUIENDO CON LOS MODELOS COMPARTIMENTALES, ESTUDIAREMOS EL PAPEL DE LA LATENCIA EN LA SEVERIDAD DE LA INFECCION POR VIH, EL MODELO SE CONTRASTARA CON DATOS EXPERIMENTALES DONDE SE ANALIZARA EL PAPEL DE LOS FARMACOS DE REVERSION DE LA LATENCIA, EN TODOS LOS NIVELES, SE HARA UN USO EXHAUSTIVO DE METODOS ESTADISTICOS DE INFERENCIA, POR LO QUE SE ANALIZARA EL PROBLEMA DE LA IDENTIFICABILIDAD DE LOS MODELOS Y NUEVAS MEDIDAS DE SENSIBILIDAD Y SINERGIA DE LOS PARAMETROS DE DE LOS MODELOS,EL EQUIPO DE INVESTIGACION ES MULTIDISCIPLINAR (FISICA, MATEMATICAS Y LNGENIERIA MECANICA) Y CONTARA CON UN EQUIPO DE TRABAJO FORMADO POR BIOLOGOS, MATEMATICOS Y FISICOS Y COLABORADORES EXPERIMENTALES QUE NOS PROPORCIONARAN DATOS EMPIRICOS PARA VALIDAR LOS MODELOS, BIOFISICA\INMUNOLOGIA\PROCESOS ESTOCASTICOS\MODELOS MATEMATICOS\SIMULACION\VIROLOGIA\ANALISIS DE DATOS
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
35K€
Líder del proyecto
UNIVERSIDAD PONTIFICIA COMILLAS
Docencia e investigacion conforme a las exigencias metodologicas y sustantivas de una institucion universitaria
Total investigadores
415
Total investigadores
415