AUTOMATIZACION Y ANALISIS EN MICROSCOPIA OPTICA. APLICACION AL DIAGNOSTICO Y PRO...
AUTOMATIZACION Y ANALISIS EN MICROSCOPIA OPTICA. APLICACION AL DIAGNOSTICO Y PRONOSTICO POR IMAGEN VIRTUAL IN VITRO EN CANCER Y PROCESOS NEURODEGENERATIVOS.
EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE UN SISTEMA QUE INTEGRE LA DIGITALIZACION AUTOMATICA DE LA IMAGEN MICROSCOPICA Y SU ANALISIS, IMAGEN QUE INCLUYE LA IMAGEN VIRTUAL IN VITRO DE BIOPSIAS, CITOLOGIAS, AUTOPSIA...
EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES EL DISEÑO E IMPLEMENTACION DE UN SISTEMA QUE INTEGRE LA DIGITALIZACION AUTOMATICA DE LA IMAGEN MICROSCOPICA Y SU ANALISIS, IMAGEN QUE INCLUYE LA IMAGEN VIRTUAL IN VITRO DE BIOPSIAS, CITOLOGIAS, AUTOPSIAS, MICROMATRICES DE TEJIDOS (TMA), HIBRIDACION MOLECULAR DE FLUORESCENCIA (FISH), CROMOGENOS (CISH O SISH) E HIBRIDACION ARN EL SISTEMA SERVIRA DE AYUDA AL DIAGNOSTICO Y PRONOSTICO DE ENFERMEDADES DE ESPECIAL INCIDENCIA COMO SON EL CANCER (PROSTATA, TUMORES DEL ESTROMA GASTROINTESTINAL O GISTS Y PULMON) Y LA ENFERMEDAD NEURODEGENERATIVA DE PARKINSON,LOS OBJETIVOS INCLUYEN: I) DESARROLLO DE UN SISTEMA DE DIGITALIZACION, TENIENDO EN CUENTA LA OPTICA Y LOS MECANISMOS DE CONTROL MAS ADECUADOS, II) COMPROBAR LA REPRESENTATIVIDAD DE LOS TMAS EN EL ESTUDIO MORFOLOGICO DE LOS TUMORES A ESTUDIO, VALORANDO ESTOS COMO HERRAMIENTA PARA EL ESTUDIO INMUNOHISTOQUIMICO (IHQ) Y LA REALIZACION DE MEJORAS MEDIANTE LAS TECNICAS MAS NOVEDOSAS DE HIBRIDACION IN SITU, SE ANALIZARAN DIFERENTES PARAMETROS ADEMAS DE MORFOMETRICOS, LOS DENSITOMETRICOS CARACTERISTICOS DE LAS PREPARACIONES, COMPARANDO CON EL ANALISIS CONVENCIONAL DE MUESTRAS Y DE TINCIONES CON HEMATOXILINA-EOSINA (HE) Y ANTICUERPOS MONOCLONALES PARA IHQ (KI67, PSA, 34BE12, ENDOGLIN/CD105 Y FACTOR DE CRECIMIENTO VASCULAR ENDOTELIAL/VEGF, EN PROSTATA; Y C-KIT/CD117, CD34, PDGFRA, KI67, P53 EN GISTS), EL SISTEMA DARA SOLUCION A LAS NECESIDADES QUE TODAVIA EXISTEN EN EL ANALISIS MICROSCOPICO PARA REALIZAR DIAGNOSTICOS OPTIMOS, ESTAS SON: A) LA DIGITALIZACION COMPLETA DE LAS MUESTRAS DE TEJIDOS Y ORGANOS, INDEPENDIENTEMENTE DE LA TINCION Y METODO DE PREPARACION, B) EL ALMACENAMIENTO Y GESTION DE TMAS, QUE INCLUYE: I) METODOS QUE PERMITAN CATALOGAR Y CORRELACIONAR LAS REGIONES DE INTERES (ROI) Y EL INFORME ANATOMOPATOLOGICO DE FORMA EFICIENTE Y SEGURA, CUMPLIENDO CON LOS ESTANDARES ACTUALES, II) METODOS DE BUSQUEDA C) ANALISIS Y PROCESADO AUTOMATICO, INCLUYENDO: I) SEGMENTACION PARA DISTINTAS TINCIONES Y METODOS DE HIBRIDACION ASI COMO LA DETECCION DE LOS CILINDROS DE TMAS Y SUS ROI, II) REGISTRO PARA LA ALINEACION DE TEJIDOS Y CILINDROS, III) RECONSTRUCCION 3D Y MODELIZACION DE ESTRUCTURAS, IV) ELIMINACION DE POSIBLE RUIDO EN LA SEÑAL Y ALTERACIONES O IRREGULARIDADES MORFOLOGICAS, D) LA CLASIFICACION Y CARACTERIZACION DE LAS ROI, CUANTIFICACION DE NIVELES DE EXPRESION Y COMPARACION DE TINCIONES PARA EL ANALISIS DE BIOMARCADORES, COMPLEMENTANDO TECNICAS DE AYUDA A LA DECISION SIMBOLISTAS CON CONEXIONISTAS, TODO ELLO MEDIANTE PROCESAMIENTO PARALELO Y DISTRIBUIDO DE LOS DATOS, PARA IMAGENES QUE CONTIENEN DEL ORDEN DE 1 A 10 GBYTES DE INFORMACION, INTEGRADO EN UN SISTEMA FLEXIBLE QUE PERMITA EL ANALISIS DE LOS DIFERENTES TIPOS DE IMAGENES MICROSCOPICAS DIAGNOS-TICAS, TANTO DE FORMA INDIVIDUAL COMO DE FORMA COLABORATIVA (BAJO ENTORNO WEB), Y CLINICAMENTE VALIDADO CUALITATIVA Y CUANTITATIVAMENTE, MEDIANTE UNA BASE DE DATOS NUMEROSA Y REPRESENTATIVA, CON 682 MUESTRAS,SE PARTIRA DEL KNOW-HOW QUE TIENE EL GRUPO SOLICITANTE Y LOS DESARROLLOS REALIZADOS EN EL ANALISIS DE IMAGEN MICROSCOPICA DE HE Y CON ANTICUERPOS MONOCLONALES PARA IHQ, GRACIAS AL PROYECTO DE I+D+I REF, DPI2004-01346, Y EXPERIENCIA DE SU COLABORADOR AITEMIN EN MICROSCOPIOS AUTOMATIZADOS, PROYECTO CGL2006-13688-C02-02, CABE MENCIONAR EL CARACTER MULTIDISCIPLINAR Y COMPLEMENTARIO DEL EQUIPO SOLICITANTE QUE ASEGURA LA FIABILIDAD, COHERENCIA, UTILIDAD DE RESULTADOS Y TRANSFERENCIA CIENTIFICO-TECNOLOGICO EN SALUD, Microscopía Virtual\Visión por Computador\Registro\Segmentación\Imágenes Biomédicas\Cáncer\Parkinson\CADver más
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