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RTI2018-101205-B-I00

Financiado

APROXIMACION ECOLOGICA Y METAGENOMICA A LAS INTERACCIONES BIOLOGICAS DEL MICROBI...

APROXIMACION ECOLOGICA Y METAGENOMICA A LAS INTERACCIONES BIOLOGICAS DEL MICROBIOMA AMBIENTAL LOS MICROORGANISMOS SON EXTREMADAMENTE ABUNDANTES Y COSMOPOLITAS EN LA BIOSFERA, POR SUS ALTAS TASAS DE CRECIMIENTO Y ALTA RELACION SUPERFICIE / VOLUMEN, SON LA SUPERFICIE BIOLOGICA MAS GRANDE Y MAS REACTIVA DE LA TIERRA, POR LO T... ver más

01/01/2018

CSIC

172K€

Presupuesto del proyecto: 172K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 172K€

Descripción del proyecto LOS MICROORGANISMOS SON EXTREMADAMENTE ABUNDANTES Y COSMOPOLITAS EN LA BIOSFERA, POR SUS ALTAS TASAS DE CRECIMIENTO Y ALTA RELACION SUPERFICIE / VOLUMEN, SON LA SUPERFICIE BIOLOGICA MAS GRANDE Y MAS REACTIVA DE LA TIERRA, POR LO TANTO, LA MAYORIA DE LAS FUNCIONES DE LOS ECOSISTEMAS ESTAN CONDICIONADAS POR LA ACTIVIDAD Y LA ABUNDANCIA DEL COMPONENTE MICROBIANO, A NIVEL GLOBAL, LOS MICROBIOS DOMINAN LOS PROCESOS RELEVANTES EN LOS ECOSISTEMAS ACUATICOS, COMO LA PRODUCCION PRIMARIA, LA RESPIRACION Y LA GENESIS Y DEGRADACION DE LAS PARTICULAS, ASIMISMO, PARTICIPAN EN LA PRODUCCION Y DEGRADACION (MINERALIZACION) DE LA MATERIA ORGANICA Y SON UNA PARTE ESENCIAL DE LOS CICLOS DE NUTRIENTES, CONSTITUYENDO LA BASE DE LA MAYORIA DE LAS CADENAS TROFICAS CON INTERES COMERCIAL, AUNQUE PASAN DESAPERCIBIDOS, SU ACTIVIDAD CONTRIBUYE DE MANERA MUY SIGNIFICATIVA A LOS FENOMENOS ATMOSFERICOS GLOBALES, CON RESPUESTAS AL CAMBIO CLIMATICO Y AL USO SOSTENIBLE DE LOS RECURSOS NATURALES IMPREDECIBLES Y POCO ESTUDIADAS, DOS DE LAS TAREAS MAS DESAFIANTES EN LA ACTUALIDAD EN ECOLOGIA MICROBIANA SON (I) LA CARACTERIZACION DE LOS GENES CON FUNCIONES DESCONOCIDAS AMPLIAMENTE PRESENTES EN LAS PROSPECCIONES METAGENOMICAS Y (II) OBTENER INFORMACION SOBRE LAS INTERACCIONES DEL MICROBIOMA IN SITU, HA HABIDO VARIOS INTENTOS DE ABORDAR ESTOS PROBLEMAS UTILIZANDO DIFERENTES METODOLOGIAS, DESDE LAS TECNICAS CLASICAS DE BIOQUIMICA O MICROBIOLOGIA, HASTA EL USO DE METODOLOGIAS COMPUTACIONALES CON DATOS GENETICOS AMBIENTALES MASIVOS, EN EL PRESENTE PROYECTO SE PROPONEN ENFOQUES COMPUTACIONALES QUE EXPLOTAN LA CO-OCURRENCIA DE GENES CON FUNCION CONOCIDA Y DESCONOCIDA Y LA CO-OCURRENCIA AMBIENTAL DE DIFERENTES ESPECIES MICROBIANAS PARA GENERAR HIPOTESIS Y PRIORIZAR OBJETIVOS DE INVESTIGACION FUTURA CON INTERES ECOLOGICO O BIOTECNOLOGICO, LA ORDENACION DE ESPECIES EN COMUNIDADES MICROBIANAS ESTA TRADICIONALMENTE VINCULADA AL FILTRADO AMBIENTAL DESVELADOS TRAS ESTUDIOS DE DISTRIBUCION AMBIENTAL DE ACUERDO CON LAS PREFERENCIAS AMBIENTALES, NUESTRA HIPOTESIS ES QUE LAS INTERACCIONES BIOTICAS (ES DECIR, EL "FILTRADO BIOTICO") SE PUEDEN CONSIDERAR UN PROCESO SIMILAR PARA ORDENAR ESPECIES MICROBIANAS DENTRO DE UNA COMUNIDAD DE ACUERDO CON LAS "PREFERENCIAS BIOTICAS" Y SE PUEDE ABORDAR UTILIZANDO METODOS ESTADISTICOS Y BIOINFORMATICOS POTENTES BASADOS EN CO-OCURRENCIAS NO ALEATORIAS DE CONJUNTOS DE DATOS MASIVOS DE MICROBIOMAS, INICIALMENTE UTILIZAREMOS SISTEMAS MICROBIANOS SIMPLIFICADOS BIEN CONOCIDOS PARA PROBAR EL ENFOQUE (LAGOS SALINOS CON FUERTES GRADIENTES DE SALINIDAD) Y, A CONTINUACION, NOS CENTRAREMOS EN LOS LAGOS ALPINOS Y LAS CO-OCURRENCIAS DE LOS POSIBLES GRUPOS DE PARASITOS ARCHAEA DPANN Y PARASITOS MICROEUCARIOTAS RECIENTEMENTE DESCRITOS, TAMBIEN EXPLORAREMOS EL FILTRADO BIOTICO DE MICROBIOMAS A LO LARGO DE ESPECIES HOSPEDADORAS DE ANIMALES Y PLANTAS EN GRADIENTES CLIMATICOS Y GEOGRAFICOS, EL ENFOQUE TAMBIEN SE APLICARA A LAS INTERACCIONES GEN-GEN EN DATASETS METAGENOMICOS PARA ABORDAR LA LLAMADA "MATERIA OSCURA BIOLOGICA" UTILIZANDO CO-OCURRENCIAS NO ALEATORIAS CON GENES DE FUNCION CONOCIDA, ES PROBABLE QUE ESTA GRAN FRACCION NO CARACTERIZADA AYUDA A CERRAR LOS MODELOS METABOLICOS EXISTENTES ORGANISMICOS Y AMBIENTALES Y OFREZCA NUEVAS POSIBILIDADES PARA LA BIOTECNOLOGIA Y LA BIOMEDICINA, EXISTE UNA GRAN FALTA DE CONOCIMIENTO PARA ESTOS DOS DESAFIOS Y CUALQUIER INFORMACION SERA BIEN RECIBIDA Y TENDRA UN ALTO IMPACTO Y ALTAS POSIBILIDADES DE APLICACION PRACTICA, MICROBIOMA\METAGENOMICA\SECUENCIACION MASIVA\16S-18S RRNA\BACTERIA\ARCHAEA\PATRONES DE CO-OCURRENCIA

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