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APERIM

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APERIM Advanced bioinformatics platform for PERsonalised cancer IMmunotherapy

Cancer treatment platforms that involve the use of the adaptive immune system have demonstrated profound tumour regressions including complete cure. Importantly, technological advances in next-generation sequencing (NGS) allow for... ver más

30/04/2018

MUI

3M€

Presupuesto del proyecto: 3M€

Líder del proyecto

MEDIZINISCHE UNIVERSITAT INNSBRUCK No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 11 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2018-04-30

PHC-32-2014: Advancing bioinformatics to meet bi... Scope:Specific challenge:Recent technological advances in molecular biology, biomedical sciences and...

I+D

Cerrada hace 11 años

0% 100%

Características del participante

Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

11 Participantes

MUI

420.54K€ | Lider

Cemit

243.36K€ | Participante

NKI AVL

279.00K€ | Participante

TRON

347.25K€ | Participante

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Duración del proyecto: 36 meses Fecha Inicio: 2015-04-07
Fecha Fin: 2018-04-30

Líder del proyecto

MEDIZINISCHE UNIVERSITAT INNSBRUCK No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 3M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Cancer treatment platforms that involve the use of the adaptive immune system have demonstrated profound tumour regressions including complete cure. Importantly, technological advances in next-generation sequencing (NGS) allow for the first time the development of personalised cancer immunotherapies that target patient specific mutations. However, clinical application is currently hampered by specific bottlenecks in bioinformatics, which we aim to address in this proposal. The overall objective of our trans-disciplinary network of leading experts in bioinformatics and cancer immunology is to develop an Advanced bioinformatics platform for PERrsonalised cancer IMmunotherapy (APERIM). Specifically we aim to develop: 1) database for the integration of NGS data, images of whole tissue slides of tumour sections, and clinical data. To enhance the usability and the data sharing we will use semantic web technologies, and will provide standardised interfaces to a set of analytical tools. 2) tools for automated quantification of tumour-infiltrating lymphocytes using whole tissue slide images and NGS data for patient stratification. 3) analytical pipeline for NGS-guided individualised cancer vaccines including crucial NGS data analysis and epitope selection components for the selection of vaccination targets. 4) a method for deriving T-cell receptor (TCR) sequences from NGS data and predicting TCR specificity. We will achieve these aims using unique training and validation datasets available to the consortium. We will develop user-friendly software modules as well as analytical standard operating procedures for clinical use, and apply the bioinformatics platform in clinical settings. The bioinformatics platform will considerably accelerate the clinical translation and maximise the accessibility and utility of biomedical data in research and medicine.

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