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BFU2015-68725-P

Financiado

ANALISIS SISTEMATICO DE REDES GENETICAS EN BIOLOGIA DEL DESARROLLO DE EXTREMIDAD...

EL DESARROLLO DE ORGANISMOS MULTICELULARES ES UN PROCESO PROFUNDAMENTE COMPLEJO, EN EL CUAL MULTIPLES TIPOS DE CELULAS CRECEN, SE DIFERENCIAN E INTERACCIONAN ENTRE ELLAS PARA CREAR ESTRUCTURAS ORGANIZADAS CON FUNCIONES INTEGRADAS,... ver más

01/01/2015

FUNDACIO PRIVADA C...

273K€

Presupuesto del proyecto: 273K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 273K€

Descripción del proyecto EL DESARROLLO DE ORGANISMOS MULTICELULARES ES UN PROCESO PROFUNDAMENTE COMPLEJO, EN EL CUAL MULTIPLES TIPOS DE CELULAS CRECEN, SE DIFERENCIAN E INTERACCIONAN ENTRE ELLAS PARA CREAR ESTRUCTURAS ORGANIZADAS CON FUNCIONES INTEGRADAS, COMO LAS EXTREMIDADES, LA REGULACION DE ESTE PROCESO ESTA GOBERNADA FUNDAMENTALMENTE POR REDES GENETICAS (GRNS) CODIFICADAS EN EL GENOMA, ESTAS REDES CONTROLAN LOS MECANISMOS DE COMUNICACION ENTRE CELULAS (A TRAVES DE VIAS DE SEÑALIZACION) Y LOS MECANISMOS DE DECISION EN CELULAS INDIVIDUALES (REDES DE FACTORES DE TRANSCRIPCION), EN CONSECUENCIA, LA COMPRENSION DEL FUNCIONAMIENTO DE REDES GENETICAS TIENE UN ENORME POTENCIAL DE IMPACTO A NIVEL CIENTIFICO Y MEDICO (PARTICULARMENTE EN REGENERACION DE ORGANOS E INGENIERIA DE TEJIDOS), ESTO REQUIERE, SIN EMBARGO, SUPERAR IMPORTANTES DESAFIOS: EL COMPORTAMIENTO Y FUNCIONES DE ESTAS REDES GENETICAS SOLO PUEDE COMPRENDERSE COMPLETAMENTE A TRAVES DE UN ENFOQUE DE BIOLOGIA DE SISTEMAS, EN EL CUAL LA DINAMICA DE TODA LA RED ES CONSIDERADO, LIMB-NET CONTRIBUIRA A ESTE ENFOQUE DE DOS MANERASEL PRIMER OBSTACULO QUE SE PRETENDE ABORDAR EN LIMB-NET ES EL HECHO DE QUE LOS INVESTIGADORES SE VEN FORZADOS A ESTUDIAR GENES INDIVIDUALMENTE (POR EJEMPLO CON MUTACIONES), LAS PUBLICACIONES CIENTIFICAS DISEMINAN LAS CONCLUSIONES MAS IMPORTANTES DE UN PROYECTO, PERO GENERALMENTE NO SON EL MEDIO ADECUADO PARA HACER PUBLICO TODOS LOS DATOS RECABADOS POR LOS AUTORES, POR ESTA RAZON, UNA IMPORTANTE CANTIDAD DE INFORMACION RELEVANTE DE ESTA DISCIPLINA (COMO POR EJEMPLO PATRONES DE EXPRESION GENETICA) SE ENCUENTRA DISTRIBUIDA AND GRUPOS DE INVESTIGACION POR TODO EL MUNDO, EL PRIMER OBJETIVO DE LIMB-NET ES PROPORCIONAR UN PLATAFORMA WEB ACCESIBLE A CUALQUIER INVESTIGADOR EN EL CAMPO DEL DESARROLLO DE EXTREMIDADES QUE LE PERMITIRA: A) EXPLORAR PATRONES 2D DE EXPRESION GENETICA (EN DISTINTOS TIEMPOS A LO LARGO DEL DESARROLLO), B) CARGAR SUS PROPIOS DATOS DE EXPRESION GENETICA EN FORMA DE IMAGENES DE WILDTYPES Y MUTANTES, C) REALIZAR SIMULACIONES CON MODELOS COMPUTACIONALES DE GRNS DE DESARROLLO DE EXTREMIDADES, ESTO CONTRIBUIRA A CONECTAR A LA COMUNIDAD CIENTIFICA EN UNA RED DINAMICA, PERMITIENDO A LOS INVESTIGADORES DESCRIBIR, DISCUTIR Y COMPARAR SUS DATOS E HIPOTESIS CON UN MARCO DE REFERENCIA COMUN,EL SEGUNDO OBSTACULO QUE SE ABORDARA EN LIMB-NET ES LA COMPLEJIDAD DE COMPRENDER LA DINAMICA TEMPORAL Y EN LAS 3 DIMENSIONES ESPACIALES DE REDES GENETICAS, CREAREMOS UNA EXTENSION DE LA BASE DE DATOS 2D - UN BASE DE DATOS 3D DE PATRONES DE EXPRESION GENETICA (USANDO NUESTRAS TECNICAS DE IMAGEN 3D) DE 200 DE LOS GENES PRINCIPALES DURANTE EL DESARROLLO (TANTO VIAS DE SEÑALIZACION COMO FACTORES DE TRANSCRIPCION), EMPLEAREMOS TECNICAS AVANZADAS DE INFERENCIA DE REDES PARA OBTENER LAS INTERACCIONES MAS PROBABLES ENTRE ESTOS GENES, FINALMENTE, REALIZAREMOS SIMULACIONES NUMERICAS DE ESTAS REDES EN UN MODELO 3D DURANTE UNA FASE FINAL DE SELECCION, PARA DILUCIDAR CUAL DE LAS POSIBLES REDES ES CAPAZ DE REPRODUCIR LA DINAMICA EN EL ESPACIO (3D) Y TIEMPO DE LOS PATRONES DE EXPRESION GENETICA OBSERVADOS EXPERIMENTALMENTE,EN SU CONJUNTO, LIMB-NET TRATARA CON DOS CLASES DE REDES FUNDAMENTALES: UNA RED DE INVESTIGADORES QUE SERA CAPAZ DE INTERACTUAR MAS EFICIENTE Y PRODUCTIVAMENTE QUE EN EL PASADO A TRAVES DE UNA PLATAFORMA ONLINE, Y UNA RED GENETICA, QUE SERA RECONSTRUIDA Y MODELADA DINAMICAMENTE, PARA ALCANZAR UN ENTENDIMIENTO A NIVEL DE BIOLOGIA DE SISTEMAS DE ESTE FASCINANTE Y FUNDAMENTAL PROCESO ORGANOGENSIS\DESAROLLO DE LAS EXTREMIDADES\GENE REGULATORY NETWORK\EXPRESSIO DE GENES\COMPUTER MODELLING\SIMULACIONES CALORIFI

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