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PID2021-123725OB-I00

Financiado

ANALISIS MOLECULAR A NIVEL CELULAR DE LA CALIDAD SEMINAL EN PORCINO

LA SOSTENIBILIDAD DE LA PRODUCCION GANADERA REQUIERE ACELERAR LA MEJORA GENETICA PARA FENOTIPOS RELACIONADOS CON LA EFICIENCIA PRODUCTIVA. PARA ELLO, SERA NECESARIO AUMENTAR LA CAPACIDAD REPRODUCTIVA DE LOS MACHOS EN CENTROS DE IN... ver más

01/01/2021

CENTRE RECERCA EN...

246K€

Presupuesto del proyecto: 246K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 246K€

Descripción del proyecto LA SOSTENIBILIDAD DE LA PRODUCCION GANADERA REQUIERE ACELERAR LA MEJORA GENETICA PARA FENOTIPOS RELACIONADOS CON LA EFICIENCIA PRODUCTIVA. PARA ELLO, SERA NECESARIO AUMENTAR LA CAPACIDAD REPRODUCTIVA DE LOS MACHOS EN CENTROS DE INSEMINACION ARTIFICIAL. EL SECTOR PORCINO ES EL MAYOR CONTRIBUYENTE A LA ECONOMIA GANADERA ESPAÑOLA Y POR TANTO, LA MEJORA DE LA CAPACIDAD REPRODUCTIVA DE LOS VERRACOS DE ELITE TENDRIA UN IMPORTANTE IMPACTO SOCIAL Y ECONOMICO. LA CAPACIDAD REPRODUCTIVA DEL VERRACO SE EVALUA MEDIANTE PARAMETROS DE CALIDAD SEMINAL, A SU LLEGADA A LOS CENTROS DE INSEMINACION ARTIFICIAL Y LAS TASAS DE RECHAZO SON ALTAS. POR LO TANTO, LA EXISTENCIA DE UN PANEL MOLECULAR PARA LA PREDICCION TEMPRANA DE LA CAPACIDAD REPRODUCTIVA DEL VERRACO EN ANIMALES JOVENES SERIA DE GRAN VALOR. TAL PANEL AUN NO EXISTE. LOS ESTUDIOS DE GWAS Y RNA-SEQ HAN AYUDADO A DILUCIDAR UNA PEQUEÑA PARTE DE LOS FACTORES MOLECULARES Y GENETICOS ASOCIADOS A LA CALIDAD SEMINAL. SIN EMBARGO, LA MAYORIA DE ESTOS FACTORES SIGUEN SIENDO ESQUIVOS CON LAS TECNICAS EMPLEADAS HASTA AHORA DEBIDO A QUE LOS CARACTERES SEMINALES SON MULTIFACTORIALES Y ESTAN INFLUENCIADOS POR MULTIPLES FACTORES GENETICOS Y AMBIENTALES. DADO QUE EL ESPERMATOZOIDE ES TRANSCRIPCIONALMENTE INACTIVO Y ES EL RESULTADO FINAL DE LA ESPERMATOGENESIS, PLANTEAMOS LA HIPOTESIS DE QUE LA CALIDAD SEMINAL DEPENDE DE LOS EVENTOS MOLECULARES QUE OCURREN EN LOS DIFERENTES TIPOS CELULARES DEL TESTICULO INVOLUCRADAS EN ESTE PROCESO DE DESARROLLO. TAMBIEN PLANTEAMOS LA HIPOTESIS DE QUE LAS TECNOLOGIAS SINGLE CELL PARA CARACTERIZAR EL TRANSCRIPTOMA Y EL EPIGENOMA A NIVEL CELULAR SON IDONEAS PARA DISECCIONAR LOS EVENTOS MOLECULARES A NIVEL CELULAR DEL TESTICULO.EN MOSEC, REALIZAREMOS SINGLE CELL MULTIOME EN EL TESTICULO DE 12 VERRACOS PIETRAIN, LANDRACE, DUROC E IBERICO, DE GRAN VALOR PARA EL SECTOR PORCINO ESPAÑOL (WORK PACKAGE -WP -1). TAMBIEN EMPLEAREMOS MULTIOME PARA COMPARAR LOS MAPAS DE GENOMICA FUNCIONAL DE LOS DIFERENTES TIPOS DE CELULAS TESTICULARES EN 10 VERRACOS PIETRAIN PERTENECIENTES A LAS COLAS DE LA DISTRIBUCION (N = 5 VERRACOS EN CADA COLA) DEL MERITO GENOMICO ESTIMADO PARA MOTILIDAD Y MORFOLOGIA DEL ESPERMATOZOIDE (WP2). ESTOS 10 CERDOS Y 50 VERRACOS ADICIONALES DE CADA COLA DE LA DISTRIBUCION DEL MERITO GENOMICO REPRODUCTIVO SE SOMETERAN A SECUENCIACION DE GENOMA COMPLETO EN POOLS PARA COMPARAR LAS FRECUENCIAS ALELICAS DE TODAS LAS VARIANTES IDENTIFICADAS EN LOS DOS GRUPOS DE CERDOS. LAS VARIANTES QUE PRESENTEN UNA FRECUENCIA ALELICA DIFERENCIAL ENTRE GRUPOS, SERAN PRIORIZADAS EN FUNCION DE SU LOCALIZACION EN LOS ELEMENTOS FUNCIONALES DEL GENOMA EN CADA TIPO CELULAR (WP2). TAMBIEN, SE LLEVARA A CABO UN EXPERIMENTO SIMILAR PARA COMPARAR LOS ELEMENTOS FUNCIONALES Y LA VARIACION GENETICA DE 2 SUBPOBLACIONES DE ESPERMATOZOIDES QUE DIFIEREN EN SU CAPACIDAD DE CAPACITACION (WP3). SE APLICARA BULK RNA-SEQ Y MNASE-SEQ EN LUGAR DE SINGLE CELL MULTIOME (WP3). EN WP4, EVALUAREMOS LA SIGNIFICACION ESTADISTICA DE LA ASOCIACION GENETICA CON CARACTERES REPRODUCTIVOS, DE UNA SELECCION DE LAS VARIANTES MAS PROMETEDORAS DE WP2 Y WP3 SEGUN SUS DIFERENCIAS EN FRECUENCIAS ALELICAS Y SU POTENCIAL FUNCIONAL. FINALMENTE, LLEVAREMOS A CABO UN ESTUDIO PARA PREDECIR LAS PROPORCIONES DE CADA TIPO CELULAR DEL TESTICULO PORCINO Y SUS TRANSCRIPTOMAS A PARTIR DE BULK RNA-SEQ (WP5). TODOS LOS ANIMALES SERAN VERRACOS DE ELITE UTILIZADOS EN ESTE ESTUDIO Y PERTENECERAN A CENTROS ESPAÑOLES DE INSEMINACION ARTIFICIAL. ALIDAD SEMINAL EN PORCINO\ASOCIACION GENETICA\CAPACITACION ESPERMATICA\ESPERMATOGENESIS\POLIMORFISMO GENETICO CAUSAL\WHOLE GENOME SEQUENCING\SINGLE CELL MULTIOME\ANOTACION GENOMICA

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