Descripción del proyecto
LA JUDIA COMUN (PHASEOLUS VULGARIS L,) ES UN IMPORTANTE CULTIVO EN TODO EL MUNDO, DEPENDIENDO DE LOS GENOTIPOS, ESTA LEGUMINOSA PUEDE SER COSECHADA FRESCA COMO JUDIA VERDE (SNAP BEAN) EN LA QUE LAS VAINAS SON RECOLECTADAS ANTES DEL DESARROLLO DE LA SEMILLA, O SECA EN EL QUE LAS SEMILLAS SON COSECHADAS CUANDO ESTAN SECAS (DRY BEAN), AMBOS GRUPOS DIFIEREN EN CARACTERES DE VAINA COMO DIMENSIONES, DUREZA Y COMPOSICION EN FIBRA, EN ESPAÑA HA SIDO RECOLECTADA UNA AMPLIA DIVERSIDAD GENETICA QUE ESTA SIENDO MANTENIDA EN COLECCIONES DE GERMOPLASMA, EL GENOMA DE JUDIA HA SIDO RECIENTEMENTE SECUENCIADO Y ANOTADO Y ES NECESARIO CONECTAR LOS DATOS GENETICOS Y GENOMICOS, EL ANALISIS GENETICO HACIA DELANTE (FENOTIPO>GENOTIPO>GENOMA) ES UNA ESTRATEGIA UTIL PARA CONOCER LOS LOCI IMPLICADOS EN EL CONTROL GENETICO DE CARACTERES RELEVANTE EN MEJORA, EN ESTA PROPUESTA, PLANTEAMOS ESTUDIAR:I) LA ESTRUCTURA Y DIVERSIDAD REUNIDAS EN UN PANEL DE 300 LINEAS QUE INCLUYE LA COLECCION NUCLEAR ESPAÑOLA DE JUDIAS,II) EL CONTROL GENETICO DE CARACTERES MORFOLOGICOS DE SEMILLA Y VAINA CON PARTICULAR ENFASIS EN ASPECTOS QUE DIFERENCIA LA JUDIA VERDE DE LA SECA,III) EL CONTROL GENETICO DE LA ROTURA DE LA SEMILLA Y EL EFECTO DE LA FECHA DE SIEMBRA SOBRE DOS LINEAS ISOGENICAS DE FABA EN LA EXPRESION DE ESTE CARACTER,IV) LA VARIACION Y EL CONTROL GENETICO DEL CONTENIDO EN FENOLES DE LA SEMILLA ASI COMO LOS PARAMETROS NUTRICIONALES Y FUNCIONALES DE LA VAINA,V) LA RESISTENCIA A ANTRACNOSIS, PARTICULARMENTE ENFOCADA SOBRE LOCI LOCALIZADOS EN LOS CLUSTERS CO-2, CO-3 Y CO-5,VI) LA ORGANIZACION DE LA RESISTENCIA A MOHO BLANCO,VII) LA RESISTENCIA A MANCHA ANGULAR INCLUYENDO LA EXPLORACION DE LA VARIACION PATOGENCIA EN EL CULTIVO LOCAL, LA RESPUESTA DE UN JUEGO DE LINEAS ISOGENICAS DE FABA Y EL PANEL DE DIVERSIDAD,PARA DESARROLLAR ESTOS OBJETIVOS, SE USARA ANALISIS GENETICO DE LIGAMIENTO, MAPEO DE QTL Y MAPEO POR ASOCIACION (GWAS), EL ANALISIS DE LIGAMIENTO Y DE QTL SE UTILIZARA PARA DELIMITAR LAS REGIONES GENOMICAS CON LOCUS O LOCI IMPLICADOS EN EL CONTROL GENETICO DE LOS CARACTERES, EL ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA (RNA-SEQ O RT-QPCR) SE USARA PARA CONOCER LOS GENES IMPLICADOS EN LA REACCION DE RESISTENCIA A ANTRACNOSIS INCLUYENDO LOS GENES LOCALIZADOS EN LAS REGIONES DELIMITADAS POR LIGAMIENTO, GWAS SE USARA PARA REVELAR LA ARQUITECTURA DE LOS CARACTERES INVESTIGADOS, SE UTILIZARA GENOTIPADO POR SECUENCIACION (GBS) EN EL GENOTIPADO MASIVO DE LA POBLACION DE MAPEO Y EL PANEL, SE ESPERA QUE TODOS LOS HALLAZGOS PUEDAN SER TRASLADADOS AL MEJORAMIENTO DE LA ESPECIE, FENOTIPADO\GENOTIPADO\CARACTERES MORFOLÓGICOS\NUTRICIONALES Y FUNCIONALES\ESTRES BIOTICO\LIGAMIENTO\ASOCIACIÓN