AMIRNAS PARA ELUCIDAR LAS FUNCIONES DESCONOCIDAS DE GENES QUE CODIFICAN PROTEINA...
AMIRNAS PARA ELUCIDAR LAS FUNCIONES DESCONOCIDAS DE GENES QUE CODIFICAN PROTEINAS PEQUEÑAS RELACIONADAS CON ESTRES AMBIENTAL
LA TIERRA ESTA EXPERIMENTANDO UN PROGRESIVO CAMBIO CLIMATICO CARACTERIZADO POR PERIODOS DE TEMPERATURAS Y PATRONES HIDRICOS EXTREMOS. ESTOS REGIMENES PLUVIOMETRICOS ALTERADOS CONDUCEN A INUNDACION DE TERRENOS Y PERIODOS DE SEQUIA....
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Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2021-01-01
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Descripción del proyecto
LA TIERRA ESTA EXPERIMENTANDO UN PROGRESIVO CAMBIO CLIMATICO CARACTERIZADO POR PERIODOS DE TEMPERATURAS Y PATRONES HIDRICOS EXTREMOS. ESTOS REGIMENES PLUVIOMETRICOS ALTERADOS CONDUCEN A INUNDACION DE TERRENOS Y PERIODOS DE SEQUIA. EN TERRENOS INUNDADOS LAS PLANTAS SUMERGIDAS COMPLETA O PARCIALMENTE EXPERIMENTAN HIPOXIA LO QUE REPRESENTA A MENUDO UN SERIO PROBLEMA PARA LA PRODUCCION AGRICOLA. LAS PLANTAS SON ORGANISMOS SESILES QUE FUNDAMENTAN SU SUPERVIVENCIA MEDIANTE UNA GRAN PLASTICIDAD QUE PERMITE REESTRUCTURAR SU FISIOLOGIA Y DESARROLLO. PARA ELLO CUENTA CON UN VASTO ARSENAL DE SENSORES Y PROTEINAS CON FUNCIONES ESTRUCTURALES, ENZIMATICAS, SEÑALIZADORAS, Y REGULADORAS QUE LE PERMITEN ADAPTARSE A LAS CONDICIONES AMBIENTALES ADVERSAS. A PESAR DEL EXTENSIVO TRABAJO REALIZADO PARA CONOCER LAS FUNCIONES DE LAS PROTEINAS, UNA ALTA PROPORCION (CERCANA AL 20% EN ARABIDOPSIS THALIANA) PERMANECE ANOTADA COMO DE FUNCION DESCONOCIDA, Y ES AUN MAYOR PARA PROTEINAS DE PEQUEÑO TAMAÑO (50% PARA PROTEINAS DE MENOS DE 100 AMINOACIDOS). UN ANALISIS SISTEMATICO DE LA FUNCION DE PEQUEÑOS PEPTIDOS Y PROTEINAS EN LAS RESPUESTAS A CONDICIONES AMBIENTALES ADVERSAS TIPICAS DEL CAMBIO CLIMATICO RESULTA DECISIVO PARA MEJORAR LA TOLERANCIA AL ESTRES. ESTE PROYECTO PRETENDE AFRONTARLO MEDIANTE LA GENERACION DE UNA COLECCION DE PLANTAS CON PERDIDA DE FUNCION DE LOS GENES QUE CODIFICAN PEPTIDOS E EL RANGO DE 80 A 100 AMINOACIDOS. COMO PRUEBA DE CONCEPTO, NOS CENTRAREMOS EN LOS GENES QUE CODIFICAN PROTEINAS EN ESTE RANGO Y QUE HEMOS IDENTIFICADO PREVIAMENTE POR RNA-SEQ COMO REGULADOS POR HIPOXIA. EL CONOCIMIENTO DE LA FUNCION DE ESTOS PEPTIDOS PERMITIRA LA IDENTIFICACION DE NUEVAS DIANAS DE INTERES AGROBIOTECNOLOGICO EN LA MEJORA DE LA TOLERANCIA FRENTE A LAS CONDICIONES HIPOXICAS IMPUESTAS POR LA ANEGACION DE LOS CAMPOS. DADO QUE NUESTRO ENFOQUE PRETENDE SER SISTEMATICO Y ESCALABLE A ALTO RENDIMIENTO, PROPONEMOS EL USO DE METODOLOGIAS FACILES, BARATAS Y EFICIENTES PARA REDUCIR LA EXPRESION GENICA BASADAS EN LA EXPRESION DE MICRORNAS ARTIFICIALES (AMIRNAS) ESPECIFICOS PARA CADA GEN. ESTA METODOLOGIA REQUIERE SOLO DEL CONOCIMIENTO DE SECUENCIA Y PUEDE RESULTAR ESPECIALMENTE UTIL PARA GENES PEQUEÑOS QUE ESTAN MUY POCO REPRESENTADOS EN LAS COLECCIONES DE MUTANTES POR INSERCION DE T-DNA. AUNQUE ESTA PROPUESTA ESTA ENFOCADA EN ARABIDOPSIS SE PUEDE APLICAR A OTRAS PLANTAS DE INTERES AGRICOLA. ADEMAS DE GENERAR INFORMACION UTIL PARA LA IDENTIFICACION Y POTENCIAL MANIPULACION DE DIANAS CLAVE EN LAS RESPUESTAS A HIPOXIA, ESTE PROYECTO PODRIA SENTAR LAS BASES DE OTROS MAS AMBICIOSOS DIRIGIDOS A ANALIZAR FUNCIONALMENTE TODAS LAS PROTEINAS PEQUEÑAS DE CADA PLANTA Y CADA CONDICION DE ESTRES. COMO RECURSO DE IMPORTANCIA ADICIONAL, LAS LINEAS QUE EXPRESEN LOS DIFERENTES AMIRNAS SE DEPOSITARAN EN UN REPOSITORIO PUBLICO PARA LIBRE ACCESO DE LA COMUNIDAD CIENTIFICA, LO QUE PERMITIRIA SU ESCRUTINIO BAJO TODO TIPO DE ESTRESES O CONDICIONES DE DESARROLLO. EPTIDOS\ARABIDOPSIS\INUNDACION\HIPOXIA\ESTRES\MICRORNA ARTIFICIAL\FUNCION DESCONOCIDA