Descripción del proyecto
EL LUPUS ERITEMATOSO SISTEMICO (LES) ES UNA ENFERMEDAD AUTOINMUNE SISTEMICA CRONICA, CARACTERIZADA POR UN CURSO CICLICO CON EXACERBACIONES Y REMISIONES. LA ENFERMEDAD PUEDE PRESENTARSE A CUALQUIER EDAD, PERO ES MAS FRECUENTE ENTRE LOS 30 Y LOS 50 AÑOS Y PREDOMINA EN MUJERES (RELACION 9:1 RESPECTO A HOMBRES), POR LO QUE MI LINEA DE INVESTIGACION TIENE EN CUENTA LA PERSPECTIVA DE GENERO. LA NEFRITIS LUPICA (NL) ES RECONOCIDA COMO UNA DE LAS MANIFESTACIONES MAS GRAVES DEL LES. ES RELEVANTE ENCONTRAR BIOMARCADORES NO INVASIVOS, FACILMENTE MEDIBLES Y ALTAMENTE SENSIBLES PARA LES, CON EL FIN DE REALIZAR UN DIAGNOSTICO TEMPRANO, EVALUAR LA ACTIVIDAD DE LA ENFERMEDAD, EL DESARROLLO DE DAÑO RENAL O MEJORAR EL TRATAMIENTO. LAS VESICULAS EXTRACELULARES (VE) HAN SIDO RECONOCIDAS COMO BUENOS BIOMARCADORES EN LES, SU FENOTIPADO MEDIANTE DIFERENTES ENFOQUES OMICOS HA PERMITIDO IDENTIFICAR FIRMAS BASADAS EN VE ASOCIADAS A LA ENFERMEDAD. NUESTRO GRUPO IDENTIFICO UNA FIRMA ESPECIFICA DE MIARN DE EXOSOMAS ASOCIADA A NL EN SANGRE PERIFERICA, QUE SE VALIDO EN UNA GRAN COHORTE DE LES. HASTA LA FECHA, SE HA DEDICADO UN GRAN ESFUERZO AL DESARROLLO DE ENSAYOS ESTANDARIZADOS Y DE BAJO COSTE DIRECTAMENTE APLICABLES A UN PEQUEÑO VOLUMEN DE MUESTRAS FRESCAS O CONGELADAS PARA LA ELABORACION DE PERFILES VE. POR LO TANTO, PROPONEMOS PRIMERO ANALIZAR EN ESTE PROYECTO EL PERFIL DE ANTIGENOS DE SUPERFICIE DE VE PARA IDENTIFICAR UNA FIRMA QUE REFLEJE LA CELULA DE ORIGEN Y SU ESTADO FISIOPATOLOGICO Y, EN SEGUNDO LUGAR, UN PERFIL DE MIARNS. AMBOS ENFOQUES, MIARNS EMPAQUETADOS Y ANTIGENOS DE SUPERFICIE, NOS DARAN UN FENOTIPADO MAS COMPLETO DE VE. EL OBJETIVO GENERAL DE ESTE PROYECTO ES DESARROLLAR UN MODELO DIAGNOSTICO AVANZADO PARA PREDECIR EL DAÑO RENAL Y LOS BROTES DE LA ENFERMEDAD EN PACIENTES CON LES, COMBINANDO NIVELES DE ANTIGENOS DE SUPERFICIE EV EXPRESADOS DIFERENCIALMENTE Y CAMBIOS EN LAS FIRMAS DE MIARN EXOSOMALES, MEDIANTE APRENDIZAJE AUTOMATICO. UTILIZAREMOS 110 PACIENTES CON LES DEL BIOBANCO DEL INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA DEL HOSPITAL CLINICO (PT13/0010/0004), 40 DE ELLOS ACTIVOS Y 70 ESTABLES. SE REALIZARA UN ANALISIS DE RNA-SEQ Y BIOINFORMATICO PARA DETECTAR LA FIRMA DE MIRNA ASOCIADA A LA INCIDENCIA Y FRECUENCIA DE LOS BROTES Y, A CONTINUACION, LOS MIRNAS CANDIDATOS SE VALIDARAN MEDIANTE RT-QPCR. ADEMAS, SE REALIZARAN ANALISIS DE 37 ANTIGENOS DE SUPERFICIE EV POR CITOMETRIA DE FLUJO EN LAS MUESTRAS DE PLASMA DE LOS MISMOS PACIENTES. LUEGO, SE HARA ANALISIS DE VESICULA UNICA PARA ESTUDIAR SI LAS VE ENRIQUECIDAS EN LOS ANTIGENOS DE SUPERFICIE ESPECIFICOS TAMBIEN CONTIENEN EL MIARN SELECCIONADO. FINALMENTE, SE UTILIZARAN ALGORITMOS SUPERVISADOS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA VALIDAR MODELOS DE DIAGNOSTICO DE DAÑO RENAL Y BROTES DE ACTIVIDAD, UTILIZANDO NMFI DE ANTIGENOS DE SUPERFICIE Y CAMBIOS EN LOS NIVELES DE MIARN, JUNTO CON VARIAS VARIABLES CLINICAS. LA CONTRIBUCION DE LA PROPUESTA A CUBRIR LAS NECESIDADES ASISTENCIALES DE LOS PACIENTES CON LES ES CLARA, IDENTIFICAR NUEVOS BIOMARCADORES MOLECULARES Y DESARROLLAR UN ALGORITMO DE PREDICCION DE NUEVOS BROTES DE ACTIVIDAD Y DAÑO RENAL PARA DESARROLLAR UN DIAGNOSTICO MAS TEMPRANO, MEJOR PRONOSTICO Y UN TRATAMIENTO MAS EFICAZ. ESTE PROYECTO SE PRIORIZA POR LA IMPORTANTE CUESTION A RESOLVER Y LA CLARA APLICABILIDAD DE LA INVESTIGACION A REALIZAR. EL PANEL MOLECULAR DE VES DESARROLLADO PODRIA SER IMPLEMENTADO EN LA PRACTICA CLINICA CON EL DESARROLLO DEL MODELO PREDICTIVO MEDIANTE APRENDIZAJE AUTOMATICO LUPUS ERITEMATOSO SISTEMICO\ALGORITMOS DIAGNOSTICO\APRENDIZAJE AUTOMATICO\INTELIGENCIA ARTIFICAL\ANTIGENOS DE SUPERFICIE\MICRORNAS\VESICULAS EXTRACELULARES