PDC2022-133415-I00
Financiado
AGRUPAMIENTO GLOBAL DE PERFILES DE MICROBIOMAS Y HERRAMIENTA DE BUSQEDA DE COMUNIDADES
LOS ORGANISMOS MULTICELULARES EUCARIOTAS, NOSOTROS INCLUIDOS, VIVEN EN INTIMA RELACION CON MICROBIOS SIMBIOTICOS MUTUALISTAS. AUNQUE ES UN TEMA CONTROVERTIDO, SE SOSTIENE QUE LA ASOCIACION ES TAN ESTRECHA Y NECESARIA PARA AMBAS PA...
LOS ORGANISMOS MULTICELULARES EUCARIOTAS, NOSOTROS INCLUIDOS, VIVEN EN INTIMA RELACION CON MICROBIOS SIMBIOTICOS MUTUALISTAS. AUNQUE ES UN TEMA CONTROVERTIDO, SE SOSTIENE QUE LA ASOCIACION ES TAN ESTRECHA Y NECESARIA PARA AMBAS PARTES COMO PARA FORMAR UNA UNIDAD DE EVOLUCION DENOMINADA "HOLOBIONTE". EN TODO CASO, DE LO QUE SI SE TIENE EVIDENCIA ES DEL IMPORTANTE PAPEL FUNCIONAL JUGADO POR DETERMINADOS TAXONES MICROBIANOS QUE FORMAN PARTE DEL MICROBIOMA PARA EL ADECUADO FUNCIONAMIENTO FISIOLOGICO DEL HOSPEDADOR. ADEMAS, A PESAR DE LA ALTA VARIABILIDAD INTER-INDIVIDUAL QUE EXHIBEN LOS MICROBIOMAS DENTRO DE ESPECIES, ES CRECIENTE LA CANTIDAD DE EVIDENCIAS DISPONIBLES QUE DEMUESTRAN QUE ESOS MICROBIOMAS ESTAN ORGANIZADOS EN TIPOS DE COMUNIDADES, UNA CUESTION RELEVANTE A LA HORA DE ESTRATIFICAR LOS ESTUDIOS POBLACIONALES Y LONGITUDINALES DE LOS MICROBIOMAS. AUNQUE UN MICROBIOMA ES INDIVIDUO ESPECIFICO CREANDO UNA HUELLA DEL MISMO, TAMBIEN ES CIERTO QUE SE PUEDEN IDENTIFICAR PROPIEDADES COMUNES QUE PERMITAN ESTABLECER DISTINTOS TIPOS DE COMUNIDADES. LA ASIGNACION DE UN MICROBIOMA DADO A UN TIPO DETERMINADO DE COMUNIDAD TIENE RELEVANCIA CLINICA. EN EFECTO, NO SOLO PUEDE AYUDAR AL DIAGNOSTICO CUANDO SE RELACIONA CON ALGUNA PATOLOGIA, SINO TAMBIEN A DETERMINAR LOS FACTORES DE RIESGO POTENCIALES O DE SUSCEPTIBILIDAD A LA APARICION DE LA MISMA O A PREDECIR EL POSIBLE EXITO DE DETERMINADOS TIPOS DE TRATAMIENTO. ESTE PROYECTO PRETENDE INNOVAR CON EL DESARROLLO DE UNA CATEGORIZACION DE LOS MICROBIOMAS A ESCALA GLOBAL. DESARROLLAREMOS UNA BASE DE DATOS DE MODELOS DE MICROBIOMAS "CLOM" (CLUSTERS OF MICROBIOMES) QUE ALMACENE PERFILES MICROBIANOS ORGANIZADOS EN TIPOS DE COMUNIDADES JUNTO A LOS METADATOS ASOCIADOS TRAS UN INTENSO TRABAJO DE BUSQUEDA Y ENRIQUECIMIENTO MANUAL DE LA INFORMACION. CLOM CONSISTE EN UNA BASE DE DATOS DE PERFILES DE MICROBIOMAS Y UN CLASIFICADOR DE PERFILES QUE EMPLEA TECNICAS DE AGRUPACION NO SUPERVISADAS. CADA TIPO DE COMUNIDAD ESTARA FORMADO POR UNA DISTRIBUCION ESPECIFICA DE TAXONES IDENTIFICADOS POR SUS VECTORES DE PROBABILIDAD, QUE SERAN OBTENIDOS RECURRIENDO A MODELOS MULTINOMIALES DIRICHLET. ASI, TRAS UNA PRIMERA RONDA DE CLASIFICACION DE MUESTRAS, DISPONDREMOS DE UNA PRIMERA BASE DE DATOS GLOBAL DE MICROBIOMAS ORGANIZADOS EN TIPOS DE COMUNIDADES. LA AGRUPACION DE DATOS Y DEFINICION DE LOS MODELOS DE MICROBIOMA SENTARA LAS BASES PARA CREAR UN CLASIFICADOR RECURRIENDO A TECNICAS DE APRENDIZAJE DE MAQUINA. FINALMENTE, EL CLASIFICADOR SE PODRA USAR PARA ASIGNAR NUEVOS PERFILES Y CALCULAR LA PROBABILIDAD DE QUE UNA MUESTRA DESCONOCIDA PERTENEZCA A UNA DETERMINADA CATEGORIA.CLOM SERA UNA HERRAMIENTA DE FUNDAMENTAL IMPORTANCIA PARA LA CARACTERIZACION Y PREDICCION DE LA MICROBIOTA, ASI COMO PARA LA ASIGNACION DE NUEVAS MUESTRAS A TIPOS DE COMUNIDADES MICROBIANAS ASOCIADAS A ENFERMEDADES. ESTA APROXIMACION SE PUEDE TRANSFERIR FACILMENTE AL SISTEMA DE SALUD PUBLICA ABRIENDO EL USO DE LOS PERFILES DE MICROBIOMAS EN UN CONTEXTO PRODUCTIVO DE DIAGNOSTICO, EN LUGAR DE RESTRINGIRSE SOLAMENTE AL DESCUBRIMIENTO Y DESCRIPCION DE MICROBIOMAS ESPECIFICOS. CLOM DISPONDRA DE APLICACIONES TALES COMO COMO: 1) UN SERVICIO WEB PARA LA CARACTERIZACION DE DATOS DE MICROBIOMAS DE NOVO; 2) ACCESO A LA BASE DE DATOS DE PERFILES Y COMUNIDADES A TRAVES DE LAS HERRAMIENTAS DE ANOTACION CLOM O DEL MISMO SERVICIO WEB; Y 3) LA CREACION DE UN "SERVICIO DE ANOTACION PERSONALIZADO" PARA PROYECTOS MAS GRANDES DONDE SE REQUIERE UN ANALISIS AD HOC.
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2022-01-01
AEI
No se conoce la línea exacta de financiación, pero conocemos el organismo encargado de la revisión del proyecto.
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
104K€
Líder del proyecto
Fundación para el Fomento de la Investigación...
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