Descripción del proyecto
Plataforma de sobremesa de secuenciación masiva de nueva generación: Sistema basado en una estrategia de secuenciación por síntesis, bien utilizando tecnología de semiconductores, midiendo la liberación de protones durante la polimerización del ADN, o bien utilizando tecnología propia de terminadores reversibles marcados que permite detectar la secuencia en cada molécula tras la incorporación de dNTPs fluorescentes en cada ciclo de síntesis, La incorporación de este sistema al SCT de Secuenciación y Genómica Funcional aseguraría la calidad y competitividad del servicio, al permitir responder a las nuevas necesidades que, respecto a la tecnología de Secuenciación, están surgiendo, La principal ventaja de esta plataforma frente a los equipos ya presentes en el SCT es la escala de trabajo, que aumentaría en varios órdenes de magnitud, y la versatilidad, Se pasaría de procesar 24/48 secuencias de una longitud máxima de 900 pb en 2 horas a poder alcanzar, con la misma dotación de personal técnico,una productividad máxima de 25 millones de lecturas por experimento, generando hasta 15Gb de datos de alta calidad en un periodo de tiempo máximo de 65 horas y a un coste razonable, pudiéndose llevar a cabo ensayos de resecuenciación de genomas completos, secuenciación de novo de genomas de microorganismos, secuenciación de transcriptomas pequeños, ensayos ChIP-Seq o ensayos CNV-Seq, inviables con los equipos disponibles en la actualidad en el servicio,