ACELERACION DE LOS PROCESOS (BIO)MOLECULARES DE RECONOCIMIENTO Y ENSAMBLAJE MOLE...
ACELERACION DE LOS PROCESOS (BIO)MOLECULARES DE RECONOCIMIENTO Y ENSAMBLAJE MOLECULAR CON METODOS COMPUTACIONALES
EL RECONOCIMIENTO MOLECULAR ES UN CONCEPTO FUNDAMENTAL EN BIOLOGIA Y DISEÑO DE FARMACOS, EN GENERAL, LOS PROCESOS BIOLOGICOS Y QUIMICOS DEPENDEN DE LA ASOCIACION Y DISOCIACION DE (BIO)MOLECULAS, ADQUIRIR UN CONOCIMIENTO PROFUNDO D...
EL RECONOCIMIENTO MOLECULAR ES UN CONCEPTO FUNDAMENTAL EN BIOLOGIA Y DISEÑO DE FARMACOS, EN GENERAL, LOS PROCESOS BIOLOGICOS Y QUIMICOS DEPENDEN DE LA ASOCIACION Y DISOCIACION DE (BIO)MOLECULAS, ADQUIRIR UN CONOCIMIENTO PROFUNDO DE ESTOS RELEVANTES PROCESOS ES ESENCIAL PARA EL DESARROLLO DE NUEVOS FARMACOS, LOS METODOS EXPERIMENTALES PUEDEN APORTAR CONOCIMIENTO ESTRUCTURAL, INFORMACION SOBRE LA AFINIDAD DE INHIBIDORES PARA SU RECEPTOR, O INFORMACION CINETICA, PERO NO OFRECEN UNA DESCRIPCION COMPLETA DEL PROCESO DE ASOCIACION Y DISOCIACION ENTRE MOLECULAS A NIVEL ATOMICO, LAS TECNICAS COMPUTACIONALES PUEDEN OFRECER UNA VISION DINAMICA Y MOLECULAR DE ESTOS PROCESOS RELEVANTES, LAS SIMULACIONES DE DINAMICA MOLECULAR SON UN BUEN CANDIDATO PARA ESTE FIN, SIN EMBARGO PARA OBTENER UNA COMPLETA DESCRIPCION DE LOS PROCESOS DE ASOCIACION Y DISOCIACION DE MOLECULAS SE REQUIERE UN ELEVADO TIEMPO DE SIMULACION QUE ACTUALMENTE ES INACCESIBLE PARA LA MAYORIA DE LA COMUNIDAD CIENTIFICA, ACTUALMENTE LOS METODOS COMPUTACIONALES PARA ESTUDIAR RECONOCIMIENTO BIOMOLECULAR REQUIEREN EL USO DE SUPERORDENADORES O LA DEFINICION DE UNA COORDENADA DE REACCION PARA PODER ACCEDER A LOS TIEMPOS DE SIMULACION NECESARIOS, EL OBJETIVO PRINCIPAL DEL PROYECTO ACCEMBLY ES DESARROLLAR UN PROTOCOLO COMPUTACIONAL PARA ESTUDIAR, A NIVEL MOLECULAR, LOS MECANISMOS DE ASOCIACION Y DISOCIACION DE BIOMOLECULAS A UN COSTE COMPUTACIONAL RAZONABLE, ESTE PROTOCOLO SE BASA EN EL METODO DE LA DINAMICA MOLECULAR ACELERADA (AMD), UNA TECNICA QUE NO REQUIERE LA DEFINICION DE NINGUNA COORDENADA DE REACCION, EN ESTE PROYECTO SE PRETENDE REFORMULAR EL METODO DE AMD PARA PODER UTILIZAR ESTA TECNICA PARA EL ESTUDIO DE LOS PROCESOS DE ASOCIACION Y DISOCIACION DE BIOMOLECULAS, EL PROTOCOLO SE EVALUARA PARA DESCRIBIR PROCESOS DE PLEGAMIENTO DE PROTEINAS, RECONOCIMIENTO MOLECULAR, E INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA, ESTE NUEVO PROTOCOLO SE UTILIZARA PARA DESCRIBIR LA ACTIVACION DE UNA PROTEINA INVOLUCRADA EN EL CANCER DE HIGADO Y PARA MEJORAR LA SELECTIVIDAD DE LOS FARMACOS UTILIZADOS ACTUALMENTE PARA INHIBIR SU FUNCION, QUÍMICA COMPUTACIONAL\DINÁMICA MOLECULAR\DISEÑO DE FÁRMACOS\INTERACCIONES PROTEÍNA-INHIBIDORver más
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