ABORDAJE MULTIESCALA DE NANOBIOSISTEMAS HIDRATADOS
ESTE SUBPROYECTO SE ENMARCA EN UN PROYECTO COORDINADO CUYO OBJETIVO GENERAL EN SU CONJUNTO ES ENTENDER LAS PROPIEDADES DINAMICAS Y ESTRUCTURALES DEL AGUA EN MATERIALES ORGANICOS, COMO PROTEINAS Y MEMBRANAS BIOLOGICAS, E INORGANIC...
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Descripción del proyecto
ESTE SUBPROYECTO SE ENMARCA EN UN PROYECTO COORDINADO CUYO OBJETIVO GENERAL EN SU CONJUNTO ES ENTENDER LAS PROPIEDADES DINAMICAS Y ESTRUCTURALES DEL AGUA EN MATERIALES ORGANICOS, COMO PROTEINAS Y MEMBRANAS BIOLOGICAS, E INORGANICOS COMO NANOPARTICULAS, NANOTUBOS DE CARBONO Y MEMBRANAS DE GRAFENO, SE ANALIZARA COMO LAS INTERFACES HIDROFOBICAS Y HIDROFILICAS AFECTAN A LAS PROPIEDADES DEL AGUA Y DE LAS SOLUCIONES ACUOSAS NANOCONFINADAS, UNA PARTE SIGNIFICATIVA DE NUESTROS ESTUDIOS SE REALIZARA A PARTIR DE SIMULACIONES DE DINAMICA MOLECULAR CLASICA, ADEMAS, SE DESARROLLARAN MODELOS DE GRANO GRUESO PARA EL AGUA QUE INCORPORARAN TAMBIEN LOS RESULTADOS DE TECNICAS DE SIMULACION AB-INITIO OBTENIDOS EN ALGUNOS CASOS ESPECIFICOS EN EL SUBPROYECTO PARTNER DE ESTE, JUNTAMENTE CON LOS RESULTADOS DE LAS SIMULACIONES ATOMISTICAS CLASICAS, ESTE ABORDAJE MULTIESCALA NOS PERMITIRAN EXTENDER NUESTRAS INVESTIGACIONES A ESCALAS DE TIEMPO Y/O LONGITUD INABORDABLES EN LAS SIMULACIONES ATOMISTICAS, EL PROYECTO COORDINADO CONSISTE EN TRES LINEAS PRINCIPALES DE INVESTIGACION QUE SE ENTRELACEN, CON LA PRIMERA EN COMUN ENTRE LOS DOS SUBPROYECTOS, EN ESTE SUBPROYECTO SE DESARROLLA PARTE DE LINEA I Y POR COMPLETO LA LINEA III, MIENTRAS QUE LA LINEA II SE INVESTIGA EN EL OTRO SUBPROYECTO, AQUI INDICAMOS LOS DISTINTOS TEMAS DE TRABAJO DE LA LINEA I Y III QUE SE TRATAN EN ESTE SUBPROYECTO, ALGUNOS CONJUNTAMENTE CON EL EQUIPO DE OTRO SUBPROYECTO,I, MEMBRANAS Y DISOLUCIONES IONICAS: SIMULACION DE MEMBRANAS CELULARES FORMADAS POR FOSFOLIPIDOS Y COLESTEROL, ANALISIS DE LAS SUPERFICIES DE ENERGIA LIBRE ION-MEMBRANA, CALCULO DEL EFECTO DE LAS ANOMALIAS DEL AGUA EN LA FUERZA DE HIDRATACION ENTRE MEMBRANAS DE FOSFOLIPIDOS EN AGUA SOBREENFRIADA Y COMPARACION CON OTROS CASOS DE INTERES, CARACTERIZACION MOLECULAR DEL AGUA DE HIDRATACION DE SUPERFICIES HIDROFILICAS Y HIDROFOBICAS EN EL CASO DE PROTEINAS Y NANOPARTICULAS,III, MODELOS DE GRANO GRUESO DE SISTEMAS HIDRATADOS: SIMULACION DE AGUA DE GRANO GRUESO EN CASOS DE INTERES EN NANOBIOLOGIA, APLICACION AL CASO DE LA DIFUSION DE IONES NANOCONFINADOS ENTRE PAREDES DE GRAFENO (EN LA DEFINICION DEL MODELO MULTIESCALA SE UTILIZARAN LOS RESULTADOS AB-INITIO DEL OTRO SUBPROYECTO), APLICACION AL CASO DE PLEGAMIENTO Y DISEÑO DE PROTEINAS, CALCULO DE POTENCIALES DE FUERZA MEDIA ENTRE PROTEINAS Y ENTRE PROTEINAS Y NANOPARTICULAS EN AGUA EXPLICITA Y ESTUDIO DE AGREGACION Y CRISTALIZACION CON ESTOS POTENCIALES, COMPARACION CON EL CASO DE INTERACCIONES A PARCHES, IMPLEMENTACION DE ESTOS POTENCIALES EN LA HERRAMIENTA DE ACCESO LIBRE BUBBLES, UTILIZO DE BUBBLE PARA EL ESTUDIO DE ADSORCION DE PROTEINAS EN NANOPARTICULAS, ESTUDIOS DE LOS EFECTOS HIDRODINAMICOS EN LA FORMACION DE LA CORONA DE PROTEINAS, NANOPARTÍCULAS\PROTEÍNAS\CORONA\AGUA\MULTIESCALA
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